RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283875.5

GTF2E1-201, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2E1, Length 3,012 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-201ENST00000283875 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.37□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 METTL15A6NJ78 407 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 KPNA5O15131 536 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PLIN3O60664 434 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TIPRLO75663 272 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 SNAP29O95721 258 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CYP2C8P10632 490 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 RAB3AP20336 220 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MAPK4P31152 587 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 DEFA1P59665 94 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 DEFA3P59666 94 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 AAK1Q2M2I8 961 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 SBK1Q52WX2 424 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ADCK1Q86TW2 530 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 YIPF5Q969M3 257 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 NXNL1Q96CM4 212 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PHOX2BQ99453 314 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TTPALQ9BTX7 342 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 BDH2Q9BUT1 245 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 M0R3G1 203 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC37A4O43826 429 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CLIC3O95833 236 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 OSBPP22059 807 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CHMP24386 653 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PSMA3P25788 255 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CNTFP26441 200 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GMPRP36959 345 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 HMGCS2P54868 508 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 IL1RL1Q01638 556 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CNTN2Q02246 1040 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GABPAQ06546 454 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PDIK1LQ8N165 341 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MAPK15Q8TD08 544 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TBCKQ8TEA7 893 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 SLC22A17Q8WUG5 538 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF566Q969W8 418 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ELMO2Q96JJ3 720 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TBCBQ99426 244 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PIP5K1AQ99755 562 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CCDC32Q9BV29 185 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 UCK2Q9BZX2 261 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 LTBP1Q14766 1721 aa7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 KBTBD13C9JR72 458 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 F8W036 122 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TLL1O43897 1013 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 XYLBO75191 536 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 SGPL1O95470 568 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 CFBP00751 764 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 APOA1P02647 267 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 C1QBP02746 253 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ALPPP05187 535 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 ZNF250P15622 560 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 TPMTP51580 245 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 RGS1Q08116 209 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 PON2Q15165 354 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 MTERF2Q49AM1 385 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 EPC2Q52LR7 807 aa7.35□□□□□ -1.23
GTF2E1-201ENST00000283875 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms