RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP1B1Q16678 543 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CCL22O00626 93 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 FYNP06241 537 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPAN19P0C672 248 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CACNG1Q06432 222 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 FERD3LQ96RJ6 166 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ACSS2Q9NR19 701 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 BBIP1A8MTZ0 92 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 STBD1O95210 358 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CST1P01037 141 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ITGA2P17301 1181 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 COPZ1P61923 177 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CDC73Q6P1J9 531 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 C19orf60Q96EN9 201 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKCZQ05513 592 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 GK5Q6ZS86 529 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 NMBRP28336 390 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 DGUOKQ16854 277 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TCF12Q99081 682 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TLE6Q9H808 572 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 GMPPBQ9Y5P6 360 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 URADA6NGE7 173 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFS2O75306 463 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 IFNA16P05015 189 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ITPKAP23677 461 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TSTD2Q5T7W7 516 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA19Q7Z5L4 167 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TK2O00142 265 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CDK14O94921 469 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ANXA8L1Q5VT79 327 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMG2Q969U7 264 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SERHLQ9NQF3 203 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 GSC2O15499 205 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 GNRH1P01148 92 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM40Q6P9F5 258 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ZYG11AQ6WRX3 759 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPAN14Q8NG11 270 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXL18Q96ME1 805 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PQ67 120 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 INSIG1O15503 277 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 LGR5O75473 907 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 DNTTP04053 509 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 IL10RBQ08334 325 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 DPYSL2Q16555 572 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 GPAT3Q53EU6 434 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBTB2Q8N680 514 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TLCD1Q96CP7 247 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SNAP91O60641 907 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 PLIN3O60664 434 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TTKP33981 857 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 GNPDA1P46926 289 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 JAG1P78504 1218 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TSSK3Q96PN8 268 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC28BQ9BUN5 200 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 NMUR1Q9HB89 426 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL1Q9NR64 748 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SPEF2Q9C093 1822 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAF3Q13114 568 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 VPS35Q96QK1 796 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms