RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NELL2Q99435 816 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CD244Q9BZW8 370 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SHOC2Q9UQ13 582 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.69□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PTPRDP23468 1912 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 OR6C75A6NL08 312 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 H3BQF6 201 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 APOL1O14791 398 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CST8O60676 142 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GRAP2O75791 330 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 OAZ2O95190 189 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CHRNB1P11230 501 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 KRT10P13645 584 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CEACAM1P13688 526 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MPLP40238 635 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ETV4P43268 484 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BRCC3P46736 316 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CCR3P51677 355 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MAP3K7CLP57077 242 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ROR1Q01973 937 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SMARCB1Q12824 385 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 KLF10Q13118 480 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DUSP8Q13202 625 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MORF4L2Q15014 288 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 KAZNQ674X7 775 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 VSTM1Q6UX27 236 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 LONP2Q86WA8 852 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RFX6Q8HWS3 928 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 KCTD6Q8NC69 237 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ITFG1Q8TB96 612 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ACTL9Q8TC94 416 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FGF13Q92913 245 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HAUS1Q96CS2 278 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZNF503Q96F45 646 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NPY6RQ99463 290 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SMOQ99835 787 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CALN1Q9BXU9 219 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CDH7Q9ULB5 785 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SNX24Q9Y343 169 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NOTCH2Q04721 2471 aa6.68□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NUP205Q92621 2012 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 LNP1A1A4G5 178 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HHLA1C9JL84 531 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CLDN5O00501 218 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CAPN9O14815 690 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ATP2C2O75185 946 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DDHD2O94830 711 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms