RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clec4fP70194 548 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pitx1P70314 315 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cd300lgQ1ERP8 331 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scube1Q6NZL8 1018 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smpd4Q6ZPR5 823 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc39a4Q78IQ7 660 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 OsgepQ8BWU5 335 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nmur2Q8BZ39 395 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fmo9Q8C116 539 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stx5Q8K1E0 355 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8R1Y2 203 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brd8Q8R3B7 951 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ArskQ9D2L1 553 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dusp6Q9DBB1 381 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jam2Q9JI59 298 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyhr1Q9QXA1 311 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RecqlQ9Z129 648 aa21.04■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr726E9Q8X3 321 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tgm2P21981 686 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gna12P27600 379 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psme3P61290 254 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rps3P62908 243 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr725Q05A45 321 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SobpQ0P5V2 864 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ces5aQ6AW46 575 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nrg1Q6DR99 700 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gramd1bQ80TI0 738 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TdrkhQ80VL1 560 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tyw3Q8BSA9 257 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Glis1Q8K1M4 789 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpina3nQ91WP6 418 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cldn3Q9Z0G9 219 aa21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nsmce4aG3XA30 381 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r10K7N621 847 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atn1O35126 1175 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif2ak2Q03963 515 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtprjQ64455 1238 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8CDN1 933 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DcxrQ91X52 244 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NtpcrQ9CQA9 190 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pbld2Q9CXN7 288 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4933425L06RikQ9D3Z8 585 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdyl2Q9D5D8 503 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A0A1Y7VP24 259 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nhsl2B1AXH1 854 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm2832F7AEC7 200 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ap3d1O54774 1199 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MaptP10637 733 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lsp1P19973 330 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hoxd8P23463 289 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccnd1P25322 295 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alox15P39654 663 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sipa1P46062 1037 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpc4P51655 557 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adra1dP97714 562 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CtscP97821 462 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 StradaQ3UUJ4 431 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prss53Q571E5 552 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc6a3Q61327 619 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ltbp3Q61810 1268 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dmc1Q61880 340 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fastkd1Q6DI86 829 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Phf24Q80TL4 400 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dyrk4Q8BI55 632 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap12Q8C0D4 838 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dennd1cQ8CFK6 786 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fads1Q920L1 447 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Alg14Q9D081 217 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dcun1d1Q9QZ73 259 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adamts5Q9R001 930 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ap4s1Q9WVL1 144 aa21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klhl32A2AJX0 620 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cilp2D3Z7H8 1162 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Galntl6E5D8G1 601 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itm2bO89051 266 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01664 111 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01878 344 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ext2P70428 718 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Irf7P70434 457 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MyrfQ3UR85 1138 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HadhQ61425 314 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubtd2Q6PGH0 234 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr834Q7TRG8 312 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgef38Q80VK6 770 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Morc4Q8BMD7 928 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PisdQ8BSF4 406 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc34Q8C0Q3 554 aa21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Impg1Q8R1W8 798 aa21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.7 ms