Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41,07■■■■■ 4,17
Hoxd8P23463 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,96■■■■□ 3,67
Hoxd8P23463 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Hoxd8P23463 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,86■■■■□ 3,33
Hoxd8P23463 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35,63■■■■□ 3,29
Hoxd8P23463 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Hoxd8P23463 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Hoxd8P23463 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Hoxd8P23463 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Hoxd8P23463 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Hoxd8P23463 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,39■■■■□ 3,1
Hoxd8P23463 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34,3■■■■□ 3,08
Hoxd8P23463 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Hoxd8P23463 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Hoxd8P23463 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Hoxd8P23463 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Hoxd8P23463 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,14■■■□□ 2,9
Hoxd8P23463 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Hoxd8P23463 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,05■■■□□ 2,88
Hoxd8P23463 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Hoxd8P23463 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Hoxd8P23463 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Hoxd8P23463 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Hoxd8P23463 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Hoxd8P23463 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Hoxd8P23463 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Hoxd8P23463 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Hoxd8P23463 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Hoxd8P23463 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Hoxd8P23463 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Hoxd8P23463 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,46■■■□□ 2,79
Hoxd8P23463 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Hoxd8P23463 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Hoxd8P23463 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Hoxd8P23463 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Hoxd8P23463 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,08■■■□□ 2,73
Hoxd8P23463 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Hoxd8P23463 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Hoxd8P23463 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Hoxd8P23463 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Hoxd8P23463 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Hoxd8P23463 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Hoxd8P23463 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Hoxd8P23463 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Hoxd8P23463 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Hoxd8P23463 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Hoxd8P23463 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Hoxd8P23463 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Hoxd8P23463 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Hoxd8P23463 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Hoxd8P23463 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Hoxd8P23463 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31,06■■■□□ 2,56
Hoxd8P23463 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Hoxd8P23463 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Hoxd8P23463 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,93■■■□□ 2,54
Hoxd8P23463 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Hoxd8P23463 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Hoxd8P23463 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
Hoxd8P23463 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Hoxd8P23463 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,8■■■□□ 2,52
Hoxd8P23463 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Hoxd8P23463 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Hoxd8P23463 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Hoxd8P23463 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,65■■■□□ 2,5
Hoxd8P23463 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Hoxd8P23463 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Hoxd8P23463 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Hoxd8P23463 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Hoxd8P23463 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Hoxd8P23463 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Hoxd8P23463 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Hoxd8P23463 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Hoxd8P23463 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Hoxd8P23463 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Hoxd8P23463 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Hoxd8P23463 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Hoxd8P23463 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Hoxd8P23463 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Hoxd8P23463 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Hoxd8P23463 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Hoxd8P23463 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Hoxd8P23463 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Hoxd8P23463 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Hoxd8P23463 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Hoxd8P23463 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Hoxd8P23463 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Hoxd8P23463 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Hoxd8P23463 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Hoxd8P23463 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Hoxd8P23463 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Hoxd8P23463 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,09■■■□□ 2,41
Hoxd8P23463 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Hoxd8P23463 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Hoxd8P23463 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Hoxd8P23463 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Hoxd8P23463 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Hoxd8P23463 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Hoxd8P23463 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Hoxd8P23463 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Hoxd8P23463 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,1 ms