Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Ap4s1Q9WVL1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Ap4s1Q9WVL1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Ap4s1Q9WVL1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,77■■■□□ 2,68
Ap4s1Q9WVL1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,29■■■□□ 2,6
Ap4s1Q9WVL1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Ap4s1Q9WVL1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Ap4s1Q9WVL1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ap4s1Q9WVL1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ap4s1Q9WVL1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,37
Ap4s1Q9WVL1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Ap4s1Q9WVL1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Ap4s1Q9WVL1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ap4s1Q9WVL1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Ap4s1Q9WVL1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Ap4s1Q9WVL1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Ap4s1Q9WVL1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,07■■■□□ 2,24
Ap4s1Q9WVL1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Ap4s1Q9WVL1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ap4s1Q9WVL1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Ap4s1Q9WVL1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Ap4s1Q9WVL1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ap4s1Q9WVL1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Ap4s1Q9WVL1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Ap4s1Q9WVL1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Ap4s1Q9WVL1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ap4s1Q9WVL1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Ap4s1Q9WVL1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Ap4s1Q9WVL1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ap4s1Q9WVL1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Ap4s1Q9WVL1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Ap4s1Q9WVL1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ap4s1Q9WVL1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Ap4s1Q9WVL1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Ap4s1Q9WVL1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ap4s1Q9WVL1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Ap4s1Q9WVL1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ap4s1Q9WVL1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ap4s1Q9WVL1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ap4s1Q9WVL1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ap4s1Q9WVL1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ap4s1Q9WVL1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ap4s1Q9WVL1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ap4s1Q9WVL1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ap4s1Q9WVL1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ap4s1Q9WVL1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ap4s1Q9WVL1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ap4s1Q9WVL1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Ap4s1Q9WVL1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Ap4s1Q9WVL1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ap4s1Q9WVL1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ap4s1Q9WVL1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Ap4s1Q9WVL1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ap4s1Q9WVL1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ap4s1Q9WVL1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ap4s1Q9WVL1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Ap4s1Q9WVL1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ap4s1Q9WVL1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ap4s1Q9WVL1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ap4s1Q9WVL1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Ap4s1Q9WVL1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ap4s1Q9WVL1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Ap4s1Q9WVL1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Ap4s1Q9WVL1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ap4s1Q9WVL1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ap4s1Q9WVL1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ap4s1Q9WVL1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ap4s1Q9WVL1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ap4s1Q9WVL1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ap4s1Q9WVL1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ap4s1Q9WVL1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ap4s1Q9WVL1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ap4s1Q9WVL1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ap4s1Q9WVL1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ap4s1Q9WVL1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Ap4s1Q9WVL1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Ap4s1Q9WVL1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ap4s1Q9WVL1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ap4s1Q9WVL1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ap4s1Q9WVL1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Ap4s1Q9WVL1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Ap4s1Q9WVL1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Ap4s1Q9WVL1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Ap4s1Q9WVL1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Ap4s1Q9WVL1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Ap4s1Q9WVL1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Ap4s1Q9WVL1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ap4s1Q9WVL1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ap4s1Q9WVL1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Ap4s1Q9WVL1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ap4s1Q9WVL1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ap4s1Q9WVL1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ap4s1Q9WVL1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ap4s1Q9WVL1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ap4s1Q9WVL1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,7 ms