RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cmtm7Q9ESD6 167 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NfkbizQ9EST8 728 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fzd2Q9JIP6 570 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Akr1c12Q9JLI0 323 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nt5cQ9JM14 200 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdkl2Q9QUK0 568 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyth1Q9QX11 398 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pkp3Q9QY23 797 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NumbQ9QZS3 653 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RecqlQ9Z129 648 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PtprfA2A8L5 1898 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Umodl1Q5DID3 1319 aa9.25□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Glipr1l3A0A1W2P7V2 236 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mcf2A2AEU1 1111 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr742A2RTP5 311 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcte1A6H639 498 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5930D3Z257 264 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kifc5bE9PUA5 672 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdr1E9Q0B4 517 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8257E9Q8R3 264 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr596F8VQ26 312 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r85G3UW56 850 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Art2bO35975 289 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc22a2O70577 553 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usp2O88623 613 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Apoa4P06728 395 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Alas2P08680 587 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Akr1b7P21300 316 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Man1a1P45700 655 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lbx1P52955 282 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CartptP56388 129 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Polr2lP62876 67 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajb14Q149L6 379 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp560Q3URI6 754 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp868Q3UTQ6 422 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abl2Q4JIM5 1182 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adora2aQ60613 410 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd6Q61003 665 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pwwp2aQ69Z61 730 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem151aQ6GQT5 468 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam126aQ6P9N1 521 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klhdc10Q6PAR0 439 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chst10Q6PGK7 356 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssxb3Q6XAS4 170 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nemp1Q6ZQE4 437 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ints7Q7TQK1 966 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1080Q7TR67 313 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Alkbh8Q80Y20 664 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ubap1Q8BH48 502 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Noc4lQ8BHY2 516 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tgif2Q8C0Y1 237 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam221bQ8C627 487 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Parp9Q8CAS9 866 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dennd1cQ8CFK6 786 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpr153Q8K0Z9 631 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Calhm5Q8R100 309 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ankrd49Q8VE42 238 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chchd4Q8VEA4 139 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smim14Q91VT8 99 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2c70Q91W64 489 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbm47Q91WT8 590 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spz1Q99MY0 378 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim12aQ99PQ1 284 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nsmce3Q9CPR8 279 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nudt14Q9D142 222 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Taf7lQ9D3R9 471 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4933425L06RikQ9D3Z8 585 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc130Q9D516 385 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rsrc1Q9DBU6 334 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prokr1Q9JKL1 393 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CtsmQ9JL96 333 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RhoaQ9QUI0 193 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sgk2Q9QZS5 367 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rbck1Q9WUB0 508 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Entpd5Q9WUZ9 427 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nfs1Q9Z1J3 459 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adamts20P59511 1906 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cacna1hO88427 2365 aa9.24□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa9.23□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa9.23□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa9.23□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm13089A2AGW7 455 aa9.23□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm14401A2ARV7 303 aa9.23□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3183D3YUJ6 481 aa9.23□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kif6E9PX57 802 aa9.23□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc149F6V035 524 aa9.23□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 3110082J24RikF6Z6Z2 108 aa9.23□□□□□ -0.93
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf683I7HJS4 458 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.5 ms