RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrrc34Q9DAM1 415 aa8.48□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Plscr2Q9DCW2 307 aa8.48□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr704Q9EPF6 315 aa8.48□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Padi3Q9Z184 664 aa8.48□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Itgb4A2A863 1818 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm28961A0A087WPA5 222 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm21858A0A087WQ24 222 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ssxb6A2BI74 170 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ttll11A4Q9F4 727 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 FanceB8JJD6 213 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Arfip1G5E8V9 373 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam91a1Q3UVG3 837 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ampd1Q3V1D3 745 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Smad3Q8BUN5 425 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Aph1bQ8C7N7 257 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Eif2b5Q8CHW4 717 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ppp1r16aQ923M0 524 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Katna1Q9WV86 491 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 DnpepQ9Z2W0 473 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Syngr1O55100 234 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Aif1O70200 147 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bnip1Q6QD59 228 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Maml1Q6T264 1020 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PolnQ7TQ07 864 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Teddm1aQ810U2 305 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Aoc2Q812C9 757 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ccdc32Q8BS39 179 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trim61Q8JZK6 461 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MfrpQ8K480 584 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 KlbQ99N32 1043 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Glod4Q9CPV4 298 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tomm20lQ9D4V6 152 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 NagaQ9QWR8 415 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm14459A2BI73 179 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lhx3P50481 400 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Defa8P50706 81 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mkl2P59759 1080 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gpr174Q3U507 335 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rxfp4Q7TQP4 414 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Svs2Q8BS30 375 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sfrp1Q8C4U3 314 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cnot6Q8K3P5 557 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nudt4Q8R2U6 179 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Snrnp48Q9D361 337 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 4933425L06RikQ9D3Z8 585 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc25a13Q9QXX4 676 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Racgap1Q9WVM1 628 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sppl2cA2A6C4 690 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r118E9Q1C1 853 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp558E9Q1J0 407 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r4K7N784 913 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r5K7N788 911 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm8897L7N294 181 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 HdcP23738 662 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prim2P33610 505 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fscn2Q32M02 492 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pde1aQ61481 565 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 XpaQ64267 272 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem161aQ8VCA6 480 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm5861F6VCN9 180 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 4933402N22RikF7D1B3 190 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Il13ra1O09030 424 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Man2b1O09159 1013 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ppp3cbP48453 525 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tapt1Q4VBD2 564 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tusc3Q8BTV1 347 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cndp1Q8BUG2 492 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tigd4Q8BUZ3 513 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cops7bQ8BV13 264 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mark4Q8CIP4 752 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr371Q8VGB8 312 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tspan1Q99J59 240 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Yaf2Q99LW6 179 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cmc1Q9CPZ8 106 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nudt14Q9D142 222 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gpr45Q9EQQ4 373 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Timp4Q9JHB3 224 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mtm1Q9Z2C5 603 aa8.47□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam46dB1ATX6 390 aa8.46□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa8.46□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tnk2O54967 1055 aa8.46□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Grm5Q3UVX5 1203 aa8.46□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Srek1ip1Q4V9W2 153 aa8.46□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Grid2Q61625 1007 aa8.46□□□□□ -1.05
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vtcn1Q7TSP5 283 aa8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.2 ms