RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VN1R3Q9BXE9 311 aa16.48■□□□□ 0.23
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP3CCP48454 512 aa16.45■□□□□ 0.22
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FLOT2Q14254 428 aa16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TPGS2Q68CL5 300 aa16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.45■□□□□ 0.22
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.45■□□□□ 0.22
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