RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 COMMD8Q9NX08 183 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 UPB1Q9UBR1 384 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 NME7Q9Y5B8 376 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 IKBKGQ9Y6K9 419 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MAU2Q9Y6X3 613 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa2.29□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 CDKL5O76039 1030 aa2.29□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CNTN5O94779 1100 aa2.29□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 GEN1Q17RS7 908 aa2.29□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 MB21D1Q8N884 522 aa2.29□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 GPR87Q9BY21 358 aa2.29□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 C1orf21Q9H246 121 aa2.29□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 EXTL2Q9UBQ6 330 aa2.29□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF585AQ6P3V2 769 aa2.29□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 MAVSQ7Z434 540 aa2.29□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SLC9B2Q86UD5 537 aa2.29□□□□□ -2.04
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