RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 WDR26Q9H7D7 661 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 NEMP2A6NFY4 417 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TMEM202A6NGA9 273 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 FFAR2O15552 330 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 AQP9O43315 295 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 NDST3O95803 873 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TSHRP16473 764 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TEAD1P28347 426 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 HK3P52790 923 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 WNT3AP56704 352 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC3Q13217 504 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PROX2Q3B8N5 592 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 FAXCQ5TGI0 409 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ATL2Q8NHH9 583 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 AP2M1Q96CW1 435 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 EID2BQ96D98 161 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TBATAQ96M53 351 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 LRRC61Q9BV99 259 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TEX101Q9BY14 249 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 SPASTQ9UBP0 616 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 KLQ9UEF7 1012 aa20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 KCNN4O15554 427 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 GCATO75600 419 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 SOD1P00441 154 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PIRTP0C851 137 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 SHC2P98077 582 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 C1orf61Q13536 156 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 RPS6KA1Q15418 735 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 HID1Q8IV36 788 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 PDXPQ96GD0 296 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 WDR24Q96S15 920 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 AGAP2Q99490 1192 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 SLC13A1Q9BZW2 595 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 CLPBQ9H078 707 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 GBA3Q9H227 469 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.9■□□□□ 0.94
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF10CO14798 259 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 RASGRP1O95267 797 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 EPOP01588 193 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SPINT3P49223 89 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 BLKP51451 505 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 MPP3Q13368 585 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FGF22Q9HCT0 170 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.89■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ALPPL2P10696 532 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CKMT2P17540 419 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SPINK2P20155 84 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 KELP23276 732 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 GPR1P46091 355 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ACADVLP49748 655 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CDK3Q00526 305 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.88■□□□□ 0.93
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