RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 PRAC2D3DTV9 90 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 TULP2O00295 520 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 VCYO14598 125 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SPARCP09486 303 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 KRT10P13645 584 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 BDKRB2P30411 391 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 ECT2LQ008S8 904 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 ZBTB17Q13105 803 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 USP41Q3LFD5 358 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 CMKLR1Q99788 373 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 ABI3Q9P2A4 366 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 J3KRW8 73 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 BUB3O43684 328 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SEC14L2O76054 403 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 NKX2-2O95096 273 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 TBX18O95935 607 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 PBX3P40426 434 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 OLR1P78380 273 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SLC20A2Q08357 652 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 RFFLQ8WZ73 363 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 FIG4Q92562 907 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 VDAC3Q9Y277 283 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 TIPRLO75663 272 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 CLCNKAP51800 687 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 RAD23BP54727 409 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 F2RL1P55085 397 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 CERS3Q8IU89 383 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 HMGCLL1Q8TB92 370 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SMARCE1Q969G3 411 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 PCYT2Q99447 389 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SH3GL2Q99962 352 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 PAGE4O60829 102 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 EGFP01133 1207 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 CD4P01730 458 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 MPP1Q00013 466 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 OLIG2Q13516 323 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 ZNF280DQ6N043 979 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 TUBA1AQ71U36 451 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SFR1Q86XK3 245 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 POC1AQ8NBT0 407 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 IGSF8Q969P0 613 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 ORAI1Q96D31 301 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 CSTL1Q9H114 145 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 DONSONQ9NYP3 566 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-210ENST00000472326 LDB3O75112 727 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 ZNF432O94892 652 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 CCNG2Q16589 344 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-210ENST00000472326 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.71□□□□□ -1.34
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