RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367525.3

UTRN-202, Transcript of utrophin, humanhuman

TSL 3

Gene UTRN, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRN-202ENST00000367525 CPNE1Q99829 537 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 DYRK4Q9NR20 520 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 TREX1Q9NSU2 369 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 APPL1Q9UKG1 709 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 SCML1Q9UN30 329 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.14□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 TSPAN11A1L157 253 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 A6NNZ2 444 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 K7EQS6 105 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ATG13O75143 517 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 SIN3BO75182 1162 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 GJB3O75712 270 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 VAPBO95292 243 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 KRT15P19012 456 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 NMBRP28336 390 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 SLC8A1P32418 973 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 HNF1BP35680 557 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 GP5P40197 560 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 EPHA4P54764 986 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ZBTB16Q05516 673 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ELP6Q0PNE2 266 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 OLIG2Q13516 323 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ARHGEF7Q14155 803 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 GALNT7Q86SF2 657 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 TTC7BQ86TV6 843 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 KCNMB4Q86W47 210 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 GPR150Q8NGU9 434 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 OR6P1Q8NGX9 317 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 OR6K2Q8NGY2 324 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 OR4L1Q8NH43 312 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 FAM3CQ92520 227 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 CHFRQ96EP1 664 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 PAFAH2Q99487 392 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 WNT16Q9UBV4 365 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 LAMA3Q16787 3333 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 CAPN8A6NHC0 703 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 SMIM23A6NLE4 172 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 C16orf96A6NNT2 1141 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 H0Y858 1186 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 H7C0S8 307 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 PSMD11O00231 422 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 PRMT3O60678 531 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 FAM155BO75949 473 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 PIGNO95427 931 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 IL1BP01584 269 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 MT-ND3P03897 115 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ERVK-10P10266 1014 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 C5AR1P21730 350 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ITGB7P26010 798 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 PMLP29590 882 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 GKP32189 559 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 VIPR1P32241 457 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 IL12RB1P42701 662 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 SLCO1A2P46721 670 aa7.12□□□□□ -1.27
UTRN-202ENST00000367525 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms