RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa18.16■□□□□ 0.5
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PKP3-201ENST00000331563 ATP6AP2O75787 350 aa18.16■□□□□ 0.5
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PKP3-201ENST00000331563 TPH1P17752 444 aa18.13■□□□□ 0.49
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PKP3-201ENST00000331563 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.13■□□□□ 0.49
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