RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 TSSK3Q96PN8 268 aa21.72■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 GPR21Q99679 349 aa21.72■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.72■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 NUAK2Q9H093 628 aa21.72■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 PIGVQ9NUD9 493 aa21.72■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 SIX4Q9UIU6 781 aa21.72■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 COL1A2P08123 1366 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 E9PAM4 449 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 LIPEQ05469 1076 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 SREBF2Q12772 1141 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 SPIDRQ14159 915 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 GPR180Q86V85 440 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 DBTP11182 482 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 TUSC3Q13454 348 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 AP5B1Q2VPB7 878 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 KLHL3Q9UH77 587 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 IMPDH2P12268 514 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 SLC1A2P43004 574 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 POLD2P49005 469 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 CYP4Z1Q86W10 505 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 ADGRE2Q9UHX3 823 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.71■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 TMEM233B4DJY2 109 aa21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 UBXN8O00124 270 aa21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 ASNA1O43681 348 aa21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 PKMP14618 531 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 MTA1Q13330 715 aa21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 TP53BP2Q13625 1128 aa21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 FAM151BQ6UXP7 276 aa21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
USP12-201ENST00000282344 MATN3O15232 486 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 NCK1P16333 377 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 PRKCHP24723 683 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 SERPINA4P29622 427 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 CRATP43155 626 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 TAF10Q12962 218 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 SLC9A7Q96T83 725 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 INAQ16352 499 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 AADATQ8N5Z0 425 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 PSMA8Q8TAA3 256 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 AOC1P19801 751 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 PQLC3Q8N755 202 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 ABHD8Q96I13 439 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 PANX1Q96RD7 426 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 SLC25A51Q9H1U9 297 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 CXorf21Q9HAI6 301 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 PCDH12Q9NPG4 1184 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 OXSMQ9NWU1 459 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 TMCO1Q9UM00 188 aa21.7■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 H3BMM5 538 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 GLUD2P49448 558 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 ACAP2Q15057 778 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 ZNF614Q8N883 585 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 SNX6Q9UNH7 406 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 SNTNA6NMZ2 147 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 PIP5K1BO14986 540 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 CLCQ05315 142 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 MAP2K5Q13163 448 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 TSTD2Q5T7W7 516 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 ALG2Q9H553 416 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 RPS7P62081 194 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 LDLRAP1Q5SW96 308 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 CASP12Q6UXS9 341 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 YAF2Q8IY57 180 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 C12orf42Q96LP6 360 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 AP3M1Q9Y2T2 418 aa21.69■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 RFXANKO14593 260 aa21.68■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 BLVRAP53004 296 aa21.68■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 CYP4F2P78329 520 aa21.68■■□□□ 1.06
USP12-201ENST00000282344 CYP4F3Q08477 520 aa21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms