RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MCU	Q8NE86	351 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HSFY1	Q96LI6	401 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NAT9	Q9BTE0	207 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CDT1	Q9H211	546 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		Q9Y3F1	56 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CLUH	O75153	1309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPRF	P10586	1907 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A087WZ62	844 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	APOL1	O14791	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NCAM2	O15394	837 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GCAT	O75600	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CNMD	O75829	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RASSF9	O75901	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT38	O76015	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TGDS	O95455	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	IFNB1	P01574	187 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	IL1B	P01584	269 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MT-ND3	P03897	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CFI	P05156	583 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LGALS2	P05162	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	INHBA	P08476	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MLN	P12872	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT10	P13645	584 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TYRP1	P17643	537 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CA4	P22748	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MARK3	P27448	753 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MIP	P30301	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEA6	P43360	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPN9	P43378	593 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINB9	P50453	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CDH6	P55285	790 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CLRN1	P58418	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ROR1	Q01973	937 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK18	Q07002	472 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NAB1	Q13506	487 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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