RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582892.1

NF1-222, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 4

Gene NF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-222	ENST00000582892	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	SLC8A1	P32418	973 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	STX2	P32856	288 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	SCNN1A	P37088	669 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PGF	P49763	221 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	RAD23B	P54727	409 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ARL4C	P56559	192 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	SNX16	P57768	344 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	OGDH	Q02218	1023 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	INCA1	Q0VD86	236 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	GPS1	Q13098	491 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	SPARCL1	Q14515	664 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	LINC00303	Q3SY05	128 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	SPATA21	Q7Z572	469 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	XYLT1	Q86Y38	959 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	CXorf38	Q8TB03	319 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ZNF398	Q8TD17	642 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TFAP2B	Q92481	460 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	MYLPF	Q96A32	169 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TBCB	Q99426	244 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PLK2	Q9NYY3	685 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	DERA	Q9Y315	318 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	C2CD2	Q9Y426	696 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	DNHD1	Q96M86	4753 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892		A0A1B0GTQ1	180 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	RASA4B	C9J798	803 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	WNT9A	O14904	365 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	RASA4	O43374	803 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	GREM1	O60565	184 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	RNF8	O76064	485 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ASMTL	O95671	621 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ALB	P02768	609 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PDGFA	P04085	211 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ERBB2	P04626	1255 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	GSTA2	P09210	222 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	CISD3	P0C7P0	127 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TYR	P14679	529 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ITGB6	P18564	788 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	CR2	P20023	1033 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PRKCH	P24723	683 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	LMO2	P25791	158 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	GCA	P28676	217 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	GRIA4	P48058	902 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	GABRE	P78334	506 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TAF10	Q12962	218 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	BNIP1	Q12981	228 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	BNIP3	Q12983	259 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TFDP2	Q14188	446 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	PDK2	Q15119	407 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	C2CD6	Q53TS8	623 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	BROX	Q5VW32	411 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	SDE2	Q6IQ49	451 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	XKR5	Q6UX68	686 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NF1-222	ENST00000582892	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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