RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 KCNK16Q96T55 309 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 NDNQ99608 321 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 MED10Q9BTT4 135 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 NDST4Q9H3R1 872 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 IL37Q9NZH6 218 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.39□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CTAGE9A4FU28 777 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 C2orf78A6NCI8 922 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SYCE1LA8MT33 242 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 NOTOA8MTQ0 251 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 BECN2A8MW95 431 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ARHGAP33O14559 1287 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ADAM23O75077 832 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SIN3BO75182 1162 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 GJB3O75712 270 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 RASSF9O75901 435 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ALDH1A2O94788 518 aa7.38□□□□□ -1.23
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RPUSD3-212ENST00000466141 OPN1MWP04001 364 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 KRT6BP04259 564 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CKMP06732 381 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SERPINF2P08697 491 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 PAEPP09466 180 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 GSTT2P0CG29 244 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 GSTT2BP0CG30 244 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 PLA2G2AP14555 144 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC9A1P19634 815 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 FUT4P22083 530 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 PON1P27169 355 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ADORA2BP29275 332 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 HMOX2P30519 316 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CLCN6P51797 869 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ZXDBP98169 803 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 MPP1Q00013 466 aa7.38□□□□□ -1.23
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RPUSD3-212ENST00000466141 KRT31Q15323 416 aa7.38□□□□□ -1.23
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RPUSD3-212ENST00000466141 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.38□□□□□ -1.23
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RPUSD3-212ENST00000466141 TCTE1Q5JU00 501 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 RETSATQ6NUM9 610 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 GJB7Q6PEY0 223 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM270Q6UE05 265 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 AKAP14Q86UN6 197 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 C12orf40Q86WS4 652 aa7.38□□□□□ -1.23
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RPUSD3-212ENST00000466141 NAXDQ8IW45 347 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.38□□□□□ -1.23
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RPUSD3-212ENST00000466141 OR8K3Q8NH51 312 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.38□□□□□ -1.23
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RPUSD3-212ENST00000466141 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 HDAC11Q96DB2 347 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 MIS12Q9H081 205 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 EBF2Q9HAK2 575 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 CBX8Q9HC52 389 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 RRN3Q9NYV6 651 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ASIC3Q9UHC3 531 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-212ENST00000466141 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.38□□□□□ -1.23
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