RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004201.7

Col5a3-201, Transcript of Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col5a3, Length 6,119 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dcdc2bF7BCK0 340 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 BpgmP15327 259 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 SPINDOCQ05AH6 381 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Itga2Q62469 1178 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Iqcf4Q6P8Y2 204 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 FggQ8VCM7 436 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 NenfQ9CQ45 171 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pgam2O70250 253 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nuak2Q8BZN4 639 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 RadxQ8C779 850 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Me2Q99KE1 589 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nif3l1Q9EQ80 376 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Abcb10Q9JI39 715 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm5145F8VQ88 278 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm4778L7N229 365 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cyp2d34L7N463 504 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 AgxtO35423 414 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Spink5Q148R4 1017 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Q3TYS2 187 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Glra2Q7TNC8 452 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Znf436Q8BPP0 452 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PpatQ8CIH9 517 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam83aQ8K2P2 436 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lrp8Q924X6 996 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 DhddsQ99KU1 333 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Med11Q9D8C6 117 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cib1Q9Z0F4 191 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lcn5A2AJB7 192 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Grip2G3XA20 1042 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam71e2L7N480 754 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hs3st1O35310 311 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rab10P61027 200 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pih1d3Q3KNI6 218 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Aldh16a1Q571I9 802 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmsb15lQ8C0W0 80 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Plcz1Q8K4D7 647 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Clcn5Q9WVD4 746 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Klhl3E0CZ16 587 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 OsmrO70458 971 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rps6ka3P18654 740 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Bmp1P98063 991 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc61Q3UJV1 511 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 P4ha2Q60716 537 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Scgb2b2Q6UGQ3 114 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Klhl6Q6V595 619 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr20Q7TRX9 314 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vmn1r206Q8R277 312 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nek6Q9ES70 313 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PpieQ9QZH3 301 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nrxn1Q9CS84 1514 aa14.49□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Smim17A0A504 109 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pramef17A2ASJ1 475 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Q6PAC4 1279 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 CarfQ8VHI4 689 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcdhga6Q91XY2 932 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cyp4f3Q99N16 524 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sytl2Q99N50 950 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pmf1Q9CPV5 202 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm45208A0A140LJ36 292 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm21319F6YNI8 144 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Per3O70361 1113 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 LgmnO89017 435 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tcf3P15806 651 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gli1P47806 1111 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nkx2-3P97334 362 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Atf4Q06507 349 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ppp2r2bQ6ZWR4 443 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pum1Q80U78 1189 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Akr1c13Q8VC28 323 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 TpmtO55060 240 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PrlP06879 226 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Wnt10bP48614 389 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mxd1P50538 227 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rgs14P97492 547 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ssx9Q6XAS3 170 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Scgb1c1Q7M742 95 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr1502Q8VG66 316 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PpigA2AR02 752 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm8871F7AXK2 190 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm11027G8JL69 66 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sult3a1O35403 293 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cdh9P70407 786 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nr2f1Q60632 422 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Il18r1Q61098 537 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Q8BGA7 448 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Q8BGK9 164 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfp446Q8C9M8 523 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcdhb10Q91VE5 797 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcdhgb2Q91XX7 928 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sod3O09164 251 aa14.48□□□□□ -0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cbfa2t3O54972 620 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.6 ms