Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,34■■■■□ 3,25
P4ha2Q60716 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
P4ha2Q60716 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
P4ha2Q60716 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
P4ha2Q60716 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,93■■■□□ 2,54
P4ha2Q60716 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,61■■■□□ 2,49
P4ha2Q60716 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,23■■■□□ 2,43
P4ha2Q60716 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
P4ha2Q60716 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
P4ha2Q60716 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
P4ha2Q60716 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
P4ha2Q60716 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
P4ha2Q60716 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
P4ha2Q60716 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
P4ha2Q60716 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
P4ha2Q60716 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
P4ha2Q60716 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
P4ha2Q60716 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
P4ha2Q60716 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,56■■■□□ 2,16
P4ha2Q60716 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
P4ha2Q60716 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,51■■■□□ 2,15
P4ha2Q60716 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
P4ha2Q60716 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
P4ha2Q60716 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
P4ha2Q60716 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
P4ha2Q60716 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
P4ha2Q60716 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
P4ha2Q60716 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
P4ha2Q60716 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
P4ha2Q60716 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
P4ha2Q60716 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
P4ha2Q60716 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,03■■■□□ 2,08
P4ha2Q60716 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
P4ha2Q60716 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
P4ha2Q60716 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
P4ha2Q60716 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
P4ha2Q60716 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
P4ha2Q60716 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
P4ha2Q60716 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
P4ha2Q60716 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
P4ha2Q60716 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
P4ha2Q60716 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
P4ha2Q60716 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,51■■□□□ 1,99
P4ha2Q60716 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,39■■□□□ 1,98
P4ha2Q60716 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
P4ha2Q60716 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
P4ha2Q60716 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
P4ha2Q60716 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,25■■□□□ 1,95
P4ha2Q60716 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
P4ha2Q60716 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
P4ha2Q60716 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
P4ha2Q60716 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,08■■□□□ 1,93
P4ha2Q60716 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
P4ha2Q60716 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
P4ha2Q60716 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
P4ha2Q60716 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,02■■□□□ 1,92
P4ha2Q60716 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
P4ha2Q60716 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
P4ha2Q60716 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
P4ha2Q60716 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
P4ha2Q60716 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
P4ha2Q60716 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
P4ha2Q60716 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
P4ha2Q60716 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
P4ha2Q60716 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
P4ha2Q60716 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
P4ha2Q60716 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
P4ha2Q60716 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,6■■□□□ 1,85
P4ha2Q60716 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
P4ha2Q60716 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
P4ha2Q60716 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
P4ha2Q60716 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
P4ha2Q60716 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
P4ha2Q60716 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
P4ha2Q60716 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
P4ha2Q60716 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
P4ha2Q60716 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
P4ha2Q60716 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
P4ha2Q60716 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
P4ha2Q60716 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,31■■□□□ 1,8
P4ha2Q60716 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
P4ha2Q60716 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,28■■□□□ 1,8
P4ha2Q60716 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
P4ha2Q60716 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26,21■■□□□ 1,79
P4ha2Q60716 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
P4ha2Q60716 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26,18■■□□□ 1,78
P4ha2Q60716 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
P4ha2Q60716 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
P4ha2Q60716 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
P4ha2Q60716 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
P4ha2Q60716 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
P4ha2Q60716 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
P4ha2Q60716 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
P4ha2Q60716 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
P4ha2Q60716 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
P4ha2Q60716 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
P4ha2Q60716 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
P4ha2Q60716 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
P4ha2Q60716 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
P4ha2Q60716 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,6 ms