Protein–RNA interactions for Protein: O89017

Lgmn, Legumain, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgmnO89017 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
LgmnO89017 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LgmnO89017 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LgmnO89017 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LgmnO89017 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LgmnO89017 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LgmnO89017 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LgmnO89017 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LgmnO89017 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
LgmnO89017 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LgmnO89017 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
LgmnO89017 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LgmnO89017 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
LgmnO89017 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LgmnO89017 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
LgmnO89017 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LgmnO89017 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LgmnO89017 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LgmnO89017 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LgmnO89017 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LgmnO89017 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LgmnO89017 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
LgmnO89017 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LgmnO89017 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LgmnO89017 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LgmnO89017 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LgmnO89017 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LgmnO89017 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LgmnO89017 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
LgmnO89017 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LgmnO89017 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
LgmnO89017 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LgmnO89017 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LgmnO89017 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LgmnO89017 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LgmnO89017 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LgmnO89017 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
LgmnO89017 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LgmnO89017 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LgmnO89017 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LgmnO89017 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LgmnO89017 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LgmnO89017 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LgmnO89017 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LgmnO89017 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LgmnO89017 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LgmnO89017 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
LgmnO89017 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LgmnO89017 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LgmnO89017 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LgmnO89017 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LgmnO89017 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LgmnO89017 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LgmnO89017 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LgmnO89017 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LgmnO89017 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LgmnO89017 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LgmnO89017 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LgmnO89017 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LgmnO89017 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LgmnO89017 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LgmnO89017 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LgmnO89017 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LgmnO89017 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LgmnO89017 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LgmnO89017 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LgmnO89017 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LgmnO89017 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LgmnO89017 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LgmnO89017 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LgmnO89017 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LgmnO89017 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LgmnO89017 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LgmnO89017 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LgmnO89017 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LgmnO89017 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LgmnO89017 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LgmnO89017 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LgmnO89017 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LgmnO89017 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LgmnO89017 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LgmnO89017 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LgmnO89017 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LgmnO89017 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LgmnO89017 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LgmnO89017 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LgmnO89017 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LgmnO89017 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LgmnO89017 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LgmnO89017 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LgmnO89017 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LgmnO89017 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LgmnO89017 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LgmnO89017 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LgmnO89017 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LgmnO89017 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LgmnO89017 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LgmnO89017 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LgmnO89017 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LgmnO89017 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms