RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 OLR1P78380 273 aa6.39□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 BNC1Q01954 994 aa6.39□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 NR6A1Q15406 480 aa6.39□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.39□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 FUT11Q495W5 492 aa6.39□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.39□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CHADLQ6NUI6 762 aa6.39□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.39□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.39□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 RNF180Q86T96 592 aa6.39□□□□□ -1.39
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BDNF-211ENST00000439476 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 RTKNQ9BST9 563 aa6.39□□□□□ -1.39
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BDNF-211ENST00000439476 ACTR8Q9H981 624 aa6.39□□□□□ -1.39
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BDNF-211ENST00000439476 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
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BDNF-211ENST00000439476 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.39□□□□□ -1.39
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BDNF-211ENST00000439476 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.38□□□□□ -1.39
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BDNF-211ENST00000439476 MLYCDO95822 493 aa6.38□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 RHOCP08134 193 aa6.38□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 LBPP18428 481 aa6.38□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 GPC1P35052 558 aa6.38□□□□□ -1.39
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