RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 NSMCE3Q96MG7 304 aa21.06■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.06■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 NUDCD1Q96RS6 583 aa21.06■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 MGME1Q9BQP7 344 aa21.06■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.06■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 GULP1Q9UBP9 304 aa21.06■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 GPR34Q9UPC5 381 aa21.06■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC187A0A096LP49 1063 aa21.05■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM202A6NGA9 273 aa21.05■□□□□ 0.96
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LIMS1-208ENST00000428064 SERPINC1P01008 464 aa21.05■□□□□ 0.96
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LIMS1-208ENST00000428064 NFKBIAP25963 317 aa21.05■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINB6P35237 376 aa21.05■□□□□ 0.96
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LIMS1-208ENST00000428064 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.05■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
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LIMS1-208ENST00000428064 ARL14Q8N4G2 192 aa21.05■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 SLC39A7Q92504 469 aa21.05■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC74AQ96AQ1 378 aa21.05■□□□□ 0.96
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LIMS1-208ENST00000428064 B4GALT6Q9UBX8 382 aa21.05■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 ATMQ13315 3056 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 D6RAR5 112 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 RARAP10276 462 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 TCF4P15884 667 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 PNLIPP16233 465 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 PBX1P40424 430 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 CDH6P55285 790 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD16Q68DU8 428 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 PNCKQ6P2M8 343 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 PAF1Q8N7H5 531 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 OR1E3Q8WZA6 343 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 IQCDQ96DY2 449 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 COQ10AQ96MF6 247 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 WDR26Q9H7D7 661 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 APPL1Q9UKG1 709 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 MGAQ8IWI9 3026 aa21.04■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 ERVH48-1M5A8F1 160 aa21.03■□□□□ 0.96
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LIMS1-208ENST00000428064 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 PGBD5Q8N414 524 aa21.03■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.03■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 HSPH1Q92598 858 aa21.03■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.03■□□□□ 0.96
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LIMS1-208ENST00000428064 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.03■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 CASC3O15234 703 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 GLB1P16278 677 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 CCKBRP32239 447 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 VIPR1P32241 457 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 ACOX1Q15067 660 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 CNGA3Q16281 694 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 CERCAMQ5T4B2 595 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 FAM71BQ8TC56 605 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 NUS1Q96E22 293 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 WBP1Q96G27 269 aa21.02■□□□□ 0.96
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LIMS1-208ENST00000428064 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.02■□□□□ 0.96
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQM1 296 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS38A1L453 326 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 KLK10O43240 276 aa21.01■□□□□ 0.95
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LIMS1-208ENST00000428064 C1QL1O75973 258 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 SERPING1P05155 500 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 CYP1A2P05177 515 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 TEAD1P28347 426 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 TPM4P67936 248 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 RHDQ02161 417 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 C19orf57Q0VDD7 668 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.01■□□□□ 0.951e-8■□□□□ 9.5
LIMS1-208ENST00000428064 MARC1Q5VT66 337 aa21.01■□□□□ 0.95
LIMS1-208ENST00000428064 TAF8Q7Z7C8 310 aa21.01■□□□□ 0.95
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