RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 ACP1P24666 158 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ITGA3P26006 1051 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PXNP49023 591 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ACTR1AP61163 376 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RPL15P61313 204 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RINT1Q6NUQ1 792 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LPCAT2Q7L5N7 544 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CTAGE6Q86UF2 777 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM126BQ8IXS8 530 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PQLC1Q8N2U9 271 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC15A4Q8N697 577 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NPIPB3Q92617 1050 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KAZALD1Q96I82 304 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CMTM3Q96MX0 182 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CACNG6Q9BXT2 260 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 LMAN1LQ9HAT1 526 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RIC8BQ9NVN3 520 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM10Q9UDY6 481 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UBXN8O00124 270 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 QSOX1O00391 747 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MITFO75030 526 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP3O75969 853 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLCO2B1O94956 709 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 GRPP07492 148 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RHOP08100 348 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CYP2C9P11712 490 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJB1P25685 340 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ECHS1P30084 290 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RFC2P35250 354 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SOX6P35712 828 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UFM1P61960 85 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2HP62256 183 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZP2Q05996 745 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC6Q16204 474 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 INAQ16352 499 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF667Q5HYK9 610 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 STXBP5Q5T5C0 1151 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CST9LP1Q5W188 147 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CDC73Q6P1J9 531 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf87Q6PH81 154 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM198BQ6UWH4 519 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA19Q7Z5L4 167 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 AMZ2Q86W34 360 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TC2NQ8N9U0 490 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6V0A1Q93050 837 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 OPTNQ96CV9 577 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF577Q9BSK1 485 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HPS4Q9NQG7 708 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RIMKLBQ9ULI2 386 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 EXOC7Q9UPT5 735 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HPSEQ9Y251 543 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 DCHS2Q6V1P9 2916 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MACROD2A1Z1Q3 448 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 WDR91A4D1P6 747 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 H0YIN7 160 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 H7C4K7 107 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ITGA10O75578 1167 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SLU7O95391 586 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CER1O95813 267 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CLTAP09496 248 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C1QTNF9P0C862 333 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 HNF1BP35680 557 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CENPAP49450 140 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SUOXP51687 545 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 STX17P56962 302 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NRG3P56975 720 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SPOCK1Q08629 439 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CBX3Q13185 183 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 RCN2Q14257 317 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 KCNAB1Q14722 419 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF568Q3ZCX4 644 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CYP27C1Q4G0S4 372 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 FAM47AQ5JRC9 791 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf76Q5T2E6 689 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC183Q5T5S1 534 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 SYT10Q6XYQ8 523 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 MICALCLQ6ZW33 695 aa2.55□□□□□ -2
CCSAP-202ENST00000366686 NLRX1Q86UT6 975 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms