RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317907.8

TTC27-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC27, Length 2,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27-201ENST00000317907 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 DNAI2Q9GZS0 605 aa10.71□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 VPS28Q9UK41 221 aa10.71□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SLC39A10Q9ULF5 831 aa10.71□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 VANGL2Q9ULK5 521 aa10.71□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CCL22O00626 93 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SOCS2O14508 198 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ADAM23O75077 832 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 C2P06681 752 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CD247P20963 164 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 NMBRP28336 390 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TUSC3Q13454 348 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 MAP7D1Q3KQU3 841 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 RAB41Q5JT25 222 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 FAM219BQ5XKK7 198 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 STEAP4Q687X5 459 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 C4orf22Q6V702 233 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 URGCPQ8TCY9 931 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TRPC4APQ8TEL6 797 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CPNE1Q99829 537 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ACBD6Q9BR61 282 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CCDC167Q9P0B6 97 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 HEATR9A2RTY3 570 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 FAM149AA5PLN7 773 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 HTR3EA5X5Y0 456 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 H3BMQ9 156 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TADA2AO75478 443 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 BMP10O95393 424 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 IGHA2P01877 340 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CKBP12277 381 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ACLYP53396 1101 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 RHDQ02161 417 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TRAF2Q12933 501 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 NR1D2Q14995 579 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CLLU1OSQ5K130 101 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 NANOGP8Q6NSW7 305 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PBXIP1Q96AQ6 731 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 COG8Q96MW5 612 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 KLHL5Q96PQ7 755 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 RBBP8Q99708 897 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ANKRD60Q9BZ19 345 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TRPC7Q9HCX4 862 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CHST12Q9NRB3 414 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GTSE1Q9NYZ3 720 aa10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TCAF2A6NFQ2 919 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GJB3O75712 270 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 IDO1P14902 403 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ZNF12P17014 697 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GRIA3P42263 894 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GLUD2P49448 558 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GNA12Q03113 381 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ITKQ08881 620 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PRKAA1Q13131 559 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CTBP1Q13363 440 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ZNF460Q14592 562 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PITRM1Q5JRX3 1037 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GRTP1Q5TC63 336 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 IL31Q6EBC2 164 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 FAM171BQ6P995 826 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CHSY3Q70JA7 882 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SCD5Q86SK9 330 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 OFCC1Q8IZS5 231 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CBR4Q8N4T8 237 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 FTHL17Q9BXU8 183 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GRID2O43424 1007 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ARSAP15289 507 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 RPL9P32969 192 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 GJA8P48165 433 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CXCR3P49682 368 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ACADVLP49748 655 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 TSPY1Q01534 308 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 CD300CQ08708 224 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SREBF2Q12772 1141 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 EFEMP1Q12805 493 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 SEMA3BQ13214 749 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 ITGADQ13349 1161 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 PMS2P3Q13401 168 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa10.69□□□□□ -0.7
TTC27-201ENST00000317907 BNIPLQ7Z465 357 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms