RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 DSELQ8IZU8 1212 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 WDSUB1Q8N9V3 476 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 BEST2Q8NFU1 509 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 STAMQ92783 540 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 RILPL2Q969X0 211 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 SIN3AQ96ST3 1273 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 SH3GL2Q99962 352 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 REEP2Q9BRK0 252 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 CNGB3Q9NQW8 809 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 ZFP57Q9NU63 452 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 PEMTQ9UBM1 199 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF711Q9Y462 761 aa4.47□□□□□ -1.69
PDCL2-201ENST00000295645 TEX22C9J3V5 150 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 CD53P19397 219 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 AGAP20933 346 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 CLCNKAP51800 687 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 CLDN2P57739 230 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 VEPH1Q14D04 833 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TAF5Q15542 800 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 SLC26A9Q7LBE3 791 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 PTPRHQ9HD43 1115 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.46□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 EDIL3O43854 480 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 SLC22A3O75751 556 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 HEXAP06865 529 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TERF1P54274 439 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TCTN1Q2MV58 587 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 NAA35Q5VZE5 725 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 MTSS1LQ765P7 747 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TAOK1Q7L7X3 1001 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 EYA3Q99504 573 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 HCN3Q9P1Z3 774 aa4.45□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 WDR81Q562E7 1941 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 IRF1P10914 325 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 POU1F1P28069 291 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TMPOP42166 694 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 KRTAP10-5P60370 271 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 SLC12A1Q13621 1099 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 BBS12Q6ZW61 710 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 GPAT4Q86UL3 456 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 KMT5CQ86Y97 462 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 WDR63Q8IWG1 891 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 HAUS8Q9BT25 410 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 ISCA1Q9BUE6 129 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 STON1Q9Y6Q2 735 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 GAGE10A6NGK3 116 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TAF4O00268 1085 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 PRSS1P07477 247 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 CFC1BP0CG36 223 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 CFC1P0CG37 223 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 CDH1P12830 882 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 MARK3P27448 753 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TIMP3P35625 211 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 GABRB2P47870 512 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 FMO5P49326 533 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 RELQ04864 619 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 GFRALQ6UXV0 394 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 DSG4Q86SJ6 1040 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 KBTBD3Q8NAB2 608 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.43□□□□□ -1.7
PDCL2-201ENST00000295645 TRIM63Q969Q1 353 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms