RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 CNGA3Q16281 694 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CDKN3Q16667 212 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF284Q2VY69 593 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 DENND5AQ6IQ26 1287 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CRTC1Q6UUV9 634 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 PRR23BQ6ZRT6 265 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00523Q86TU6 105 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SUMF1Q8NBK3 374 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 MNS1Q8NEH6 495 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 HACD3Q9P035 362 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 DMTF1Q9Y222 760 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa13.27□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 USP34Q70CQ2 3546 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PPC4 97 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 FAM187AA6NFU0 413 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 MEI4A8MW99 385 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 TTI1O43156 1089 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 MMP20O60882 483 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 USP12O75317 370 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 TM7SF2O76062 418 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 APRTP07741 180 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 ELFN1P0C7U0 828 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 C6P13671 934 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 GM2AP17900 193 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CD27P26842 260 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 DPP6P42658 865 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 LIG3P49916 1009 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SEMG2Q02383 582 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 ARHGEF7Q14155 803 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 FGL2Q14314 439 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SPARCL1Q14515 664 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 PTPRRQ15256 657 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 WDR45BQ5MNZ6 344 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 LYSMD4Q5XG99 296 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC66Q68CR7 880 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN33Q86UF1 283 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A41Q8N5S1 370 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB119Q8N690 84 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 DENND6BQ8NEG7 585 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CPT1BQ92523 772 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 APOL2Q9BQE5 337 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SLC17A9Q9BYT1 436 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 TRABDQ9H4I3 376 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 EBF2Q9HAK2 575 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 RAB23Q9ULC3 237 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF711Q9Y462 761 aa13.26□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 IGLON5A6NGN9 336 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 PROB1E7EW31 1015 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 EPN2O95208 641 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 IVDP26440 423 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 HOXD12P35452 270 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 LMAN1P49257 510 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 STC1P52823 247 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CDH17Q12864 832 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 LAIR1Q6GTX8 287 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 ARMCX6Q7L4S7 300 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CYP2U1Q7Z449 544 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 MAATS1Q7Z4T9 603 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CEP112Q8N8E3 955 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 C1orf216Q8TAB5 229 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 COQ10AQ96MF6 247 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 L2HGDHQ9H9P8 463 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CASS4Q9NQ75 786 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 FAM86C1Q9NVL1 165 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 KCTD5Q9NXV2 234 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 ASIC3Q9UHC3 531 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SPO11Q9Y5K1 396 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 VPS13AQ96RL7 3174 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 KNL1Q8NG31 2342 aa13.25□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CTAGE15A4D2H0 777 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 A8MX80 341 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 RAD51CO43502 376 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CLDN7O95471 211 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 C1SP09871 688 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 PIRTP0C851 137 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 CTAGE8P0CG41 777 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 ITPKAP23677 461 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 ADCY8P40145 1251 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 PTSQ03393 145 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 SGCGQ13326 291 aa13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
CCDC42-201ENST00000293845 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms