RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028950.8

Sdcbp2-201, Transcript of Syntenin-2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sdcbp2, Length 1,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Znf532Q6NXK2 1036 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 DdiasQ6NZG4 898 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Cdc14bQ6PFY9 485 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Tlr11Q6R5P0 926 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Zswim6Q80TB7 1207 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Trmt12Q8BG71 446 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 MtbpQ8BJS8 894 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Cgrrf1Q8BMJ7 332 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Cdcp2Q8BQH6 427 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Cep57Q8CEE0 500 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Upp2Q8CGR7 320 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ugt3a2Q8JZZ0 523 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Scamp1Q8K021 338 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Pkn3Q8K045 878 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Nfatc4Q8K120 901 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Plcl2Q8K394 1128 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Rpusd1Q8VCZ8 306 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Olfr665Q8VG79 316 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Caskin2Q8VHK1 1201 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Cyyr1Q8VIH7 165 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Slc39a3Q99K24 317 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ecrg4Q99LS0 148 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Retreg3Q9CQV4 466 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 ProzQ9CQW3 399 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Vkorc1Q9CRC0 161 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 3300002I08RikQ9CXH3 147 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 ApmapQ9D7N9 415 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 2010109A12RikQ9D875 119 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Q9D979 236 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Zswim2Q9D9X6 631 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Cldn19Q9ET38 224 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 PnckQ9QYK9 343 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 IL36RNQ9QYY1 156 aa9.6□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Serpine3E9Q6A2 401 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Vmn2r70K7N702 854 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Sema3aO08665 772 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Hsd17b7O88736 334 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Srp54P14576 504 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 CtskP55097 329 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Clec4fP70194 548 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ctps1P70698 591 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 ItkQ03526 625 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Wdr41Q3UDP0 460 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Mrgprx2Q3UG50 352 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Esrp1Q3US41 680 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Rnf223Q3UV31 285 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Trim38Q5SZ99 471 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Map2k2Q63932 401 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Prr18Q6PAN7 307 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Asic3Q6X1Y6 530 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ubfd1Q78JW9 368 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Impg2Q80XH2 1243 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Dnajb13Q80Y75 316 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 B3galnt2Q8BG28 504 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 AW551984Q8BGF0 804 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Slu7Q8BHJ9 585 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Taf15Q8BQ46 557 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Olfml1Q8BSH2 233 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 B4gat1Q8BWP8 415 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Pnpla8Q8K1N1 776 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 LipmQ8K2A6 422 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Prpsap2Q8R574 369 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Mtmr6Q8VE11 617 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Olfr868Q8VFI8 309 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Olfr371Q8VGB8 312 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Creld1Q91XD7 420 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Golph3Q9CRA5 298 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Cfap57Q9D180 1249 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa9.59□□□□□ -0.87
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Igkv12-98A0A0G2JGF9 115 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Gm31371A0A1D5RM70 265 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Zfp395E9Q5N9 508 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Scgb2b19J3QM75 112 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 GzmkO35205 263 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 ChkbO55229 394 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Klra1P20937 262 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Kif5cP28738 956 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Alox12P39655 663 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 PnmtP40935 295 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ccr7P47774 378 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Slc1a1P51906 523 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Acot8P58137 320 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Lhx1P63006 406 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Olfm3P63056 478 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Nsun2Q1HFZ0 757 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Fam105aQ3TVP5 353 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Mylk3Q3UIZ8 795 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Nr1d1Q3UV55 615 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Zkscan4Q5SZT6 480 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ggt1Q60928 568 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Mapk10Q61831 464 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Kiss1Q6Y4S4 130 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Pnma8aQ80VM8 430 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 WhrnQ80VW5 918 aa9.58□□□□□ -0.88
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 CcnyQ8BGU5 341 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms