Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Prpsap2Q8R574 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Prpsap2Q8R574 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Prpsap2Q8R574 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Prpsap2Q8R574 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Prpsap2Q8R574 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Prpsap2Q8R574 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Prpsap2Q8R574 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Prpsap2Q8R574 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Prpsap2Q8R574 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Prpsap2Q8R574 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Prpsap2Q8R574 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Prpsap2Q8R574 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Prpsap2Q8R574 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prpsap2Q8R574 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Prpsap2Q8R574 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Prpsap2Q8R574 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Prpsap2Q8R574 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Prpsap2Q8R574 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Prpsap2Q8R574 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Prpsap2Q8R574 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Prpsap2Q8R574 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Prpsap2Q8R574 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Prpsap2Q8R574 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Prpsap2Q8R574 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Prpsap2Q8R574 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Prpsap2Q8R574 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Prpsap2Q8R574 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Prpsap2Q8R574 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Prpsap2Q8R574 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Prpsap2Q8R574 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Prpsap2Q8R574 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Prpsap2Q8R574 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Prpsap2Q8R574 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Prpsap2Q8R574 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Prpsap2Q8R574 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Prpsap2Q8R574 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Prpsap2Q8R574 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Prpsap2Q8R574 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Prpsap2Q8R574 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prpsap2Q8R574 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Prpsap2Q8R574 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Prpsap2Q8R574 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Prpsap2Q8R574 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Prpsap2Q8R574 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Prpsap2Q8R574 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Prpsap2Q8R574 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Prpsap2Q8R574 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Prpsap2Q8R574 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Prpsap2Q8R574 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prpsap2Q8R574 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prpsap2Q8R574 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prpsap2Q8R574 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prpsap2Q8R574 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prpsap2Q8R574 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Prpsap2Q8R574 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Prpsap2Q8R574 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Prpsap2Q8R574 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Prpsap2Q8R574 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Prpsap2Q8R574 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Prpsap2Q8R574 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prpsap2Q8R574 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prpsap2Q8R574 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prpsap2Q8R574 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prpsap2Q8R574 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prpsap2Q8R574 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Prpsap2Q8R574 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Prpsap2Q8R574 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prpsap2Q8R574 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Prpsap2Q8R574 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Prpsap2Q8R574 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prpsap2Q8R574 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prpsap2Q8R574 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prpsap2Q8R574 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prpsap2Q8R574 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prpsap2Q8R574 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prpsap2Q8R574 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Prpsap2Q8R574 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Prpsap2Q8R574 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prpsap2Q8R574 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prpsap2Q8R574 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prpsap2Q8R574 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prpsap2Q8R574 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prpsap2Q8R574 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prpsap2Q8R574 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prpsap2Q8R574 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prpsap2Q8R574 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prpsap2Q8R574 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Prpsap2Q8R574 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prpsap2Q8R574 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prpsap2Q8R574 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prpsap2Q8R574 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prpsap2Q8R574 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prpsap2Q8R574 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prpsap2Q8R574 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prpsap2Q8R574 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prpsap2Q8R574 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prpsap2Q8R574 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Prpsap2Q8R574 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prpsap2Q8R574 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms