RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621829.4

CLTC-215, Transcript of clathrin heavy chain, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CLTC, Length 8,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLTC-215	ENST00000621829	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829		F5H5T6	163 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	SLC30A4	O14863	429 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PRMT3	O60678	531 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	IDNK	Q5T6J7	187 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CYP4X1	Q8N118	509 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CISH	Q9NSE2	258 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829		A0A0J9YYE9	177 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55	9e-8	■□□□□ 11.3
CLTC-215	ENST00000621829	MED24	O75448	989 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FTH1	P02794	183 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	BMP7	P18075	431 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TAS2R41	P59536	307 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PGBD3	Q8N328	593 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ART4	Q93070	314 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PDE10A	Q9Y233	779 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	KLHL33	A6NCF5	533 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829		H3BSA7	217 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CCR1	P32246	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CDH4	P55283	916 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	COL26A1	Q96A83	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	OR52E6	Q96RD3	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	HSPB11	Q9Y547	144 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	NOBOX	O60393	691 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MYL4	P12829	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TNNI3	P19429	210 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TYMP	P19971	482 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	NAE1	Q13564	534 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MKLN1	Q9UL63	735 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	C5orf51	A6NDU8	294 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PRKACB	P22694	351 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	AQP1	P29972	269 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	RORC	P51449	518 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	RAB15	P59190	212 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	OR5J2	Q8NH18	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MTRR	Q9UBK8	725 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829		A8MX80	341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	BBOX1	O75936	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	MUT	P22033	750 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FMO3	P31513	532 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PLD1	Q13393	1074 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	NLN	Q9BYT8	704 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	HDAC3	O15379	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	NUDT17	P0C025	328 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CDH1	P12830	882 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PSMB4	P28070	264 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	PCSK1	P29120	753 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	IL2	P60568	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	SLC18A2	Q05940	514 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829		H0YJX3	145 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLTC-215	ENST00000621829	TIE1	P35590	1138 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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