RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RMND5AQ9H871 391 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SIPA1L1O43166 1804 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CARNS1A5YM72 827 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 M0R3G1 203 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 VWA5AO00534 786 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GRID2O43424 1007 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 UGT2B4P06133 528 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NCK1P16333 377 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TFEBP19484 476 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 AVPR1AP37288 418 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ACADSBP45954 432 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CLCN3P51790 818 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TMBIM6P55061 237 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 LAMC2Q13753 1193 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DGCR6Q14129 220 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 COLEC12Q5KU26 742 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 XAF1Q6GPH4 301 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MFSD4AQ8N468 514 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ESX1Q8N693 406 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SEPHS2Q99611 448 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 BEX2Q9BXY8 128 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF302Q9NR11 478 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 AASSQ9UDR5 926 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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PTPRT-211ENST00000618610 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HDAC3O15379 428 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DYRK3O43781 588 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GPC4O75487 556 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DAB1O75553 588 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TPPPO94811 219 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ALX3O95076 343 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CD40LGP29965 261 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GNG2P59768 71 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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PTPRT-211ENST00000618610 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 BIRC7Q96CA5 298 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TEPSINQ96N21 525 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CGRRF1Q99675 332 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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PTPRT-211ENST00000618610 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SNX15Q9NRS6 342 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 RNF181Q9P0P0 153 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SATB2Q9UPW6 733 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CDYLQ9Y232 598 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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PTPRT-211ENST00000618610 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6AP2O75787 350 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 TSPAN9O75954 239 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ARIH2O95376 493 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CHRM3P20309 590 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 ENPP1P22413 925 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CLCNKBP51801 687 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 NCS1P62166 190 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 GPLD1P80108 840 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 KIZQ2M2Z5 673 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 PMF1Q6P1K2 205 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRT-211ENST00000618610 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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