RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 GATA6Q92908 595 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 OLFM3Q96PB7 478 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 AMACRQ9UHK6 382 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ALG6Q9Y672 507 aa17.82■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 TOR1BO14657 336 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 APOL1O14791 398 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 FZD6O60353 706 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ELFN1P0C7U0 828 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 CCNB1P14635 433 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 CDKN2BP42772 138 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 MARCKSL1P49006 195 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ACADVLP49748 655 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 DSC2Q02487 901 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PROX2Q3B8N5 592 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 NPNTQ6UXI9 565 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 MACC1Q6ZN28 852 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 CCDC13Q8IYE1 715 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PAF1Q8N7H5 531 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 OR4C6Q8NH72 309 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ARRDC2Q8TBH0 407 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 LGMNQ99538 433 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 MSRB2Q9Y3D2 182 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 HEY1Q9Y5J3 304 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ASPMQ8IZT6 3477 aa17.81■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 A8MX80 341 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 SIGLEC6O43699 453 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PDHA1P08559 390 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 LHCGRP22888 699 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 CDC25BP30305 580 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 VIPR1P32241 457 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 THOP1P52888 689 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ZBTB17Q13105 803 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PTPRRQ15256 657 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 CNGA3Q16281 694 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 RFX6Q8HWS3 928 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 RBFAQ8N0V3 343 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 CCNYQ8ND76 341 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 TPCN2Q8NHX9 752 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PIH1D2Q8WWB5 315 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 IL12RB2Q99665 862 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ANP32EQ9BTT0 268 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PHTF1Q9UMS5 762 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PPIL1Q9Y3C6 166 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 RAI2Q9Y5P3 530 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa17.8■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 USP24Q9UPU5 2620 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 MYLKQ15746 1914 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 H3BM21 787 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 KCNK1O00180 336 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 FFAR2O15552 330 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PCCBP05166 539 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 C1QTNF9P0C862 333 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 JUNDP17535 347 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PEX5P50542 639 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 DYNLT1P63172 113 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ITKQ08881 620 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 NIPAL4Q0D2K0 466 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 MTM1Q13496 603 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PTK2BQ14289 1009 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 INPP5AQ14642 412 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ARMC12Q5T9G4 340 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 CNTD1Q8N815 330 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PLA2G15Q8NCC3 412 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ACRBPQ8NEB7 543 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 COQ10AQ96MF6 247 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 NLGN3Q9NZ94 848 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 TTLL3Q9Y4R7 772 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 OR1A2Q9Y585 309 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 BTNL10A8MVZ5 291 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 SCAMP1O15126 338 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 RFPL3O75679 317 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 NEBLO76041 1014 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 MMP2P08253 660 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 KRT10P13645 584 aa17.78■□□□□ 0.44
CS-219ENST00000550655 ADCY2Q08462 1091 aa17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms