RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 VSTM4Q8IW00 320 aa13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 EXD3Q8N9H8 876 aa13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 WDR48Q8TAF3 677 aa13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 IQCDQ96DY2 449 aa13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 GPR27Q9NS67 375 aa13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 STARD5Q9NSY2 213 aa13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 NENFQ9UMX5 172 aa13.82□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC187A0A096LP49 1063 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 DFFAO00273 331 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ITGB2P05107 769 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ITGA2BP08514 1039 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SFTPCP11686 197 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 INHBCP55103 352 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 NR0B2Q15466 257 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 DPYSL2Q16555 572 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 TPRG1LQ5T0D9 272 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 Q6ZSR6 202 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 TTC7BQ86TV6 843 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 VPS36Q86VN1 386 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 HSPH1Q92598 858 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 NCAPGQ9BPX3 1015 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 NUP85Q9BW27 656 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ZWILCHQ9H900 591 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ETNK2Q9NVF9 386 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 DONSONQ9NYP3 566 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ANAPC7Q9UJX3 599 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa13.81□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 MMP20O60882 483 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CYP1A2P05177 515 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 RARAP10276 462 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 NME1P15531 152 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 TIMP2P16035 220 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 HCAR3P49019 387 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 RPIAP49247 311 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 NFKB2Q00653 900 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SGCGQ13326 291 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 LINC00303Q3SY05 128 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC122Q5T0U0 273 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CRTC1Q6UUV9 634 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 POLNQ7Z5Q5 900 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 PARGQ86W56 976 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ZSWIM9Q86XI8 627 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CPNE8Q86YQ8 564 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 NIPA2Q8N8Q9 360 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 DENND6BQ8NEG7 585 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 EXTL1Q92935 676 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 GLMNQ92990 594 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 NAT6Q93015 286 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SGF29Q96ES7 293 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 IL12RB2Q99665 862 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SP110Q9HB58 689 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 DKK3Q9UBP4 350 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SEPT3Q9UH03 358 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SALL4Q9UJQ4 1053 aa13.8□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 TSPAN11A1L157 253 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 PMS2P1A4D2B8 440 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 H3BRJ5 948 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 FPGTO14772 594 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 MUSKO15146 869 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 AQP9O43315 295 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SUV39H1O43463 412 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 PALMO75781 387 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CSF2P04141 144 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 AMPD1P23109 780 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 IGFALSP35858 605 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ARL4AP40617 200 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 TRIM14Q14142 442 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SPIDRQ14159 915 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 FZD2Q14332 565 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 BOLA3Q53S33 107 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CAMK1DQ8IU85 385 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CXorf40AQ8TE69 158 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 ASB12Q8WXK4 309 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 NSMCE3Q96MG7 304 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
CHTF18-212ENST00000493715 SUV39H2Q9H5I1 410 aa13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms