RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.79■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRSK1Q8TDC3 778 aa18.79■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD49Q8WVL7 239 aa18.79■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPON2Q9BUD6 331 aa18.79■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM17Q9Y577 477 aa18.79■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC100653049A0A140TA62 436 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN11O75508 207 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT34O76011 436 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDST3O95803 873 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOT2P00505 430 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIRTP0C851 137 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COX4I1P13073 169 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGSHP51688 502 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OXCT1P55809 520 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTR3P61158 418 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC6Q16204 474 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF461Q8TAF7 563 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GKN1Q9NS71 199 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL4A6Q14031 1691 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDELR3O43731 214 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBX10O75333 385 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABLIM3O94929 683 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLP2RO95838 553 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JUNP05412 331 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBP1P09455 135 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNA5P22460 613 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINB5P36952 375 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGRP47804 291 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SESN3P58005 492 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACAP2Q15057 778 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RALGPS1Q5JS13 557 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACAD11Q709F0 780 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM1BQ8NB78 822 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR13C4Q8NGS5 318 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR150Q8NGU9 434 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC126Q96EE4 140 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNDP1Q96KN2 507 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYRFLQ96LU7 910 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC42Q9Y546 428 aa18.78■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC162PA2VCL2 907 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A8MT66 165 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PARNO95453 639 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GCKP35557 465 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf146Q5VVC0 180 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM45BPQ6NSW5 357 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM207Q6UWW9 146 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM45AQ8TCE6 357 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RIMKLBQ9ULI2 386 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDYLQ9Y232 598 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.77■□□□□ 0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ILVBLA1L0T0 632 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM233B4DJY2 109 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IPO13O94829 963 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RHOCP08134 193 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGAXP20702 1163 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC26A3P40879 764 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC34A1Q06495 639 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PEX6Q13608 980 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CUL3Q13618 768 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEMA3AQ14563 771 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAF11Q15544 211 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRNIPQ6NTE8 343 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHST9Q7L1S5 443 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIM3Q86V86 326 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DTX3LQ8TDB6 740 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTRT2Q8TDY3 377 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXOC2Q96KP1 924 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC28BQ9BUN5 200 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF38Q9H0F5 515 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP4F11Q9HBI6 524 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP4F12Q9HCS2 524 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YIPF1Q9Y548 306 aa18.77■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GVM2 712 aa18.76■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.76■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZMPSTE24O75844 475 aa18.76■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VEGFBP49765 207 aa18.76■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLD1Q13393 1074 aa18.76■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms