RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF77Q15935 545 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 GAB3Q8WWW8 586 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 HMCESQ96FZ2 354 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 E2F8A0AVK6 867 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM18P0DKX4 95 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 BGNP21810 368 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PEX2P28328 305 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PPIL6Q8IXY8 311 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 BANPQ8N9N5 519 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 MZB1Q8WU39 189 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TTC17Q96AE7 1141 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.48■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GVM2 712 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 KCNK1O00180 336 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TM9SF1O15321 606 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TGDSO95455 350 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 RPL5P46777 297 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 BBS9Q3SYG4 887 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CHST9Q7L1S5 443 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CPXM2Q8N436 756 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 FGF13Q92913 245 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PHF12Q96QT6 1004 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CEP41Q9BYV8 373 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 RNF103O00237 685 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TBL1XO60907 577 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CLDN11O75508 207 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CLPTM1O96005 669 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 EMP3P54852 163 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 WASHC5Q12768 1159 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PALM2Q8IXS6 379 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CAPN14A8MX76 684 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 MAFKO60675 156 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 RAMP2O60895 175 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 NADK2Q4G0N4 442 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 RNF111Q6ZNA4 994 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PCGF5Q86SE9 256 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SLC26A7Q8TE54 656 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 BHMTQ93088 406 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TSGA13Q96PP4 275 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SLX1AQ9BQ83 275 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 CLDND1Q9NY35 253 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 GCATO75600 419 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TFAP2AP05549 437 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TCF3P15923 654 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 S1PR5Q9H228 398 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 TAGLN3Q9UI15 199 aa20.46■□□□□ 0.87
UBE2B-201ENST00000265339 XIRP2A4UGR9 3374 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0A0MRY4 1105 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM63AO94886 807 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 PTPN3P26045 913 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 TRIP10Q15642 601 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL38Q2WGJ6 581 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 SPATA13Q96N96 652 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 PAK5Q9P286 719 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 MEI4A8MW99 385 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-201ENST00000265339 NDC80O14777 642 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms