RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mup5P11591 180 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem165P52875 323 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gbp10Q000W5 611 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tespa1Q3U132 458 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rbm44Q3V089 1013 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fndc11Q80WB0 326 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SvopQ8BFT9 548 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TpbglQ8C013 384 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bend5Q8C6D4 421 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acsm2Q8K0L3 575 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CtsqQ91ZF4 343 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cldn3Q9Z0G9 219 aa17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa17.14■□□□□ 0.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slfn9B1ARD6 910 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FgaE9PV24 789 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm2832F7AEC7 200 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MrasO08989 208 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Anxa5P48036 319 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp3cbP48453 525 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Txnl4aP83877 142 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rpl10Q6ZWV3 214 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slfn5Q8CBA2 884 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Katnbl1Q9CWJ3 299 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DtnaQ9D2N4 746 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rhox9Q9EQM5 227 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nt5cQ9JM14 200 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r53L7N473 806 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Krt4P07744 525 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smpd1Q04519 627 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Col28a1Q2UY11 1141 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem102Q3UPR7 509 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sytl5Q80T23 753 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TbcelQ8C5W3 424 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx8Q8CFD4 459 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stx5Q8K1E0 355 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Unc93b1Q8VCW4 598 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp6cQ9CQR6 305 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 VasnQ9CZT5 673 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4930524N10RikQ9D519 233 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam162aQ9D6U8 155 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Oser1Q9D722 291 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B4galt4Q9JJ04 344 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdh17Q9R100 827 aa17.14■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r3A2AMT7 306 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Phf11A6H5X4 337 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc9a3G3X939 829 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r61L7N2B8 865 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fzd6Q61089 709 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrfn2Q80TG9 788 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lair1Q8BG84 263 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r205Q8R276 316 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r79Q8R285 306 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mtmr14Q8VEL2 648 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mark1Q8VHJ5 795 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CinpQ9D0V8 212 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem80Q9D3H0 123 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc130Q9D516 385 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plxna4Q80UG2 1893 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc4a9E9PUP3 929 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Svs4P18419 113 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Man1a1P45700 655 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TubP50586 505 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HdxQ14B70 692 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc22a23Q3UHH2 689 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sorbs2Q3UTJ2 1180 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd13bQ5F259 626 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Brsk2Q69Z98 735 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Otud6aQ6IE21 290 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rtl3Q6P1Y1 553 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tlr12Q6QNU9 906 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp6v1g3Q8BMC1 118 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mbtps2Q8CHX6 515 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vps39Q8R5L3 886 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mgea5Q9EQQ9 916 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 St6galnac1Q9QZ39 526 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itgb1bp2Q9R000 350 aa17.13■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f15A0A087WR44 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f12A0A0A0MQP3 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf19bA2A7Q9 732 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f9A2BFZ7 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f7A2BHG6 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f19A2CG71 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f10A2CG92 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f3A2CGC2 496 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f13B8JKF6 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem233D3Z1U7 110 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f2J3QMS5 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f25J3QMV9 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f6J3QMW9 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd35f26J3QNK2 498 aa17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.5 ms