Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Snx8Q8CFD4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Snx8Q8CFD4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Snx8Q8CFD4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Snx8Q8CFD4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Snx8Q8CFD4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Snx8Q8CFD4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Snx8Q8CFD4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Snx8Q8CFD4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Snx8Q8CFD4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Snx8Q8CFD4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Snx8Q8CFD4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Snx8Q8CFD4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Snx8Q8CFD4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Snx8Q8CFD4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Snx8Q8CFD4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Snx8Q8CFD4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Snx8Q8CFD4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Snx8Q8CFD4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Snx8Q8CFD4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Snx8Q8CFD4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snx8Q8CFD4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Snx8Q8CFD4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Snx8Q8CFD4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Snx8Q8CFD4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Snx8Q8CFD4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Snx8Q8CFD4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Snx8Q8CFD4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snx8Q8CFD4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Snx8Q8CFD4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Snx8Q8CFD4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Snx8Q8CFD4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Snx8Q8CFD4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snx8Q8CFD4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snx8Q8CFD4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snx8Q8CFD4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Snx8Q8CFD4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Snx8Q8CFD4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Snx8Q8CFD4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Snx8Q8CFD4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snx8Q8CFD4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snx8Q8CFD4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snx8Q8CFD4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Snx8Q8CFD4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx8Q8CFD4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Snx8Q8CFD4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snx8Q8CFD4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Snx8Q8CFD4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Snx8Q8CFD4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snx8Q8CFD4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snx8Q8CFD4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snx8Q8CFD4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snx8Q8CFD4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snx8Q8CFD4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx8Q8CFD4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx8Q8CFD4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snx8Q8CFD4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx8Q8CFD4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snx8Q8CFD4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snx8Q8CFD4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snx8Q8CFD4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snx8Q8CFD4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snx8Q8CFD4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Snx8Q8CFD4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx8Q8CFD4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Snx8Q8CFD4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx8Q8CFD4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx8Q8CFD4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Snx8Q8CFD4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Snx8Q8CFD4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx8Q8CFD4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snx8Q8CFD4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx8Q8CFD4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx8Q8CFD4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx8Q8CFD4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx8Q8CFD4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx8Q8CFD4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx8Q8CFD4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx8Q8CFD4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx8Q8CFD4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx8Q8CFD4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snx8Q8CFD4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx8Q8CFD4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snx8Q8CFD4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Snx8Q8CFD4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx8Q8CFD4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx8Q8CFD4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Snx8Q8CFD4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx8Q8CFD4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx8Q8CFD4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snx8Q8CFD4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx8Q8CFD4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx8Q8CFD4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx8Q8CFD4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx8Q8CFD4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snx8Q8CFD4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx8Q8CFD4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snx8Q8CFD4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snx8Q8CFD4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Snx8Q8CFD4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.9 ms