Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT7

Vmn1r3, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r3A2AMT7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Vmn1r3A2AMT7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,44■■■□□ 2,94
Vmn1r3A2AMT7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Vmn1r3A2AMT7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,27■■■□□ 2,76
Vmn1r3A2AMT7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,32■■■□□ 2,61
Vmn1r3A2AMT7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Vmn1r3A2AMT7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Vmn1r3A2AMT7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Vmn1r3A2AMT7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Vmn1r3A2AMT7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Vmn1r3A2AMT7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Vmn1r3A2AMT7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Vmn1r3A2AMT7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Vmn1r3A2AMT7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Vmn1r3A2AMT7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Vmn1r3A2AMT7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Vmn1r3A2AMT7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Vmn1r3A2AMT7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Vmn1r3A2AMT7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Vmn1r3A2AMT7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Vmn1r3A2AMT7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Vmn1r3A2AMT7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Vmn1r3A2AMT7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Vmn1r3A2AMT7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Vmn1r3A2AMT7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Vmn1r3A2AMT7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Vmn1r3A2AMT7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Vmn1r3A2AMT7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Vmn1r3A2AMT7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Vmn1r3A2AMT7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Vmn1r3A2AMT7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Vmn1r3A2AMT7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Vmn1r3A2AMT7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Vmn1r3A2AMT7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Vmn1r3A2AMT7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Vmn1r3A2AMT7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Vmn1r3A2AMT7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Vmn1r3A2AMT7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Vmn1r3A2AMT7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Vmn1r3A2AMT7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Vmn1r3A2AMT7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Vmn1r3A2AMT7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Vmn1r3A2AMT7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Vmn1r3A2AMT7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Vmn1r3A2AMT7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Vmn1r3A2AMT7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Vmn1r3A2AMT7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Vmn1r3A2AMT7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Vmn1r3A2AMT7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Vmn1r3A2AMT7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Vmn1r3A2AMT7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Vmn1r3A2AMT7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Vmn1r3A2AMT7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Vmn1r3A2AMT7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Vmn1r3A2AMT7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Vmn1r3A2AMT7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Vmn1r3A2AMT7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Vmn1r3A2AMT7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Vmn1r3A2AMT7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Vmn1r3A2AMT7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Vmn1r3A2AMT7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Vmn1r3A2AMT7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Vmn1r3A2AMT7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Vmn1r3A2AMT7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
Vmn1r3A2AMT7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Vmn1r3A2AMT7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Vmn1r3A2AMT7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Vmn1r3A2AMT7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Vmn1r3A2AMT7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Vmn1r3A2AMT7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Vmn1r3A2AMT7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Vmn1r3A2AMT7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Vmn1r3A2AMT7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Vmn1r3A2AMT7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Vmn1r3A2AMT7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Vmn1r3A2AMT7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Vmn1r3A2AMT7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Vmn1r3A2AMT7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Vmn1r3A2AMT7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Vmn1r3A2AMT7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Vmn1r3A2AMT7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Vmn1r3A2AMT7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Vmn1r3A2AMT7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Vmn1r3A2AMT7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Vmn1r3A2AMT7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Vmn1r3A2AMT7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Vmn1r3A2AMT7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Vmn1r3A2AMT7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Vmn1r3A2AMT7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Vmn1r3A2AMT7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Vmn1r3A2AMT7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vmn1r3A2AMT7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Vmn1r3A2AMT7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Vmn1r3A2AMT7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Vmn1r3A2AMT7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Vmn1r3A2AMT7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Vmn1r3A2AMT7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Vmn1r3A2AMT7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Vmn1r3A2AMT7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Vmn1r3A2AMT7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms