RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 ARL8AQ96BM9 186 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 C18orf8Q96DM3 657 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 MCRS1Q96EZ8 462 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 SCLT1Q96NL6 688 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 ZIM3Q96PE6 472 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 CPXM1Q96SM3 734 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 SH3GL2Q99962 352 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 ERP44Q9BS26 406 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 MLST8Q9BVC4 326 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 TXLNGYQ9BZA5 131 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 DCLK3Q9C098 648 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 DPH5Q9H2P9 285 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 FAM114A2Q9NRY5 505 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 KIAA1257Q9ULG3 409 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 GINS2Q9Y248 185 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 SNX24Q9Y343 169 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 NFS1Q9Y697 457 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 SCINQ9Y6U3 715 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PODXLO00592 558 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 NRP1O14786 923 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PSTPIP1O43586 416 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 STC2O76061 302 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 RECQL4O94761 1208 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ENDOD1O94919 500 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 GASTP01350 101 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 KCNE1P15382 129 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 IVDP26440 423 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PTPN7P35236 360 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 FNTAP49354 379 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 FLT3LGP49771 235 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 FAM193AP78312 1265 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 DR1Q01658 176 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 TAP1Q03518 808 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MGAT3Q09327 533 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 GPS2Q13227 327 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 SOWAHAQ2M3V2 549 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 GLRA4Q5JXX5 417 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 CYP4A22Q5TCH4 519 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 LRRC38Q5VT99 294 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MFSD14CQ5VZR4 134 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 C9orf57Q5W0N0 161 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 DNAJC24Q6P3W2 148 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 LCLAT1Q6UWP7 414 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 FAM228AQ86W67 206 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 VRK3Q8IV63 474 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 RCOR2Q8IZ40 523 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PRR18Q8N4B5 295 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ZNF276Q8N554 614 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 LRRC52Q8N7C0 313 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 NIPA2Q8N8Q9 360 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 KLHDC9Q8NEP7 349 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 BEST2Q8NFU1 509 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 OR7D4Q8NG98 312 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 EXD1Q8NHP7 514 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 C1orf54Q8WWF1 131 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 SLCO2A1Q92959 643 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MCEEQ96PE7 176 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 TRIM31Q9BZY9 425 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 BCO1Q9HAY6 547 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MED4Q9NPJ6 270 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MIOSQ9NXC5 875 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PSD3Q9NYI0 1048 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 GRIN2DO15399 1336 aa5.64□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 DOCK5Q9H7D0 1870 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PI4K2BG5E9Z4 385 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA8SH3BPF8 625 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 TULP2O00295 520 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 PTGESO14684 152 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 TP73O15350 636 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 SEPT4O43236 478 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-205ENST00000546248 HCRTO43612 131 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms