RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489495.5

FUBP1-211, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene FUBP1, Length 2,156 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-211ENST00000489495 ZFP69Q49AA0 526 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 WDR44Q5JSH3 913 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 LDLRAP1Q5SW96 308 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 FNBP1LQ5T0N5 605 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 FAXCQ5TGI0 409 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 BROXQ5VW32 411 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 SYCE2Q6PIF2 218 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 ZNF773Q6PK81 442 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 NSMFQ6X4W1 530 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 RCOR2Q8IZ40 523 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 MFSD4AQ8N468 514 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 SFRP1Q8N474 314 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 KCNH5Q8NCM2 988 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 PIK3C3Q8NEB9 887 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 BEST2Q8NFU1 509 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 STK35Q8TDR2 534 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 SNX19Q92543 992 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 HDAC11Q96DB2 347 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 ASB9Q96DX5 294 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 BTN2A3PQ96KV6 586 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 ISCA1Q9BUE6 129 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 ACAT2Q9BWD1 397 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 EFCAB1Q9HAE3 211 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 MKNK2Q9HBH9 465 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 TRIM39Q9HCM9 518 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 PNPLA8Q9NP80 782 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 DNPEPQ9ULA0 475 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 POLHQ9Y253 713 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 TMEM2Q9UHN6 1383 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 MROH5Q6ZUA9 1318 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 LTBP3Q9NS15 1303 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 C16orf96A6NNT2 1141 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 F5H423 210 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 GOLGA8SH3BPF8 625 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 TRIM77I1YAP6 450 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 CYB561D2O14569 222 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 CLIC2O15247 247 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 CFLARO15519 480 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 SLC37A4O43826 429 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 NMT2O60551 498 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 BANF1O75531 89 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 PROSCO94903 275 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 EPN2O95208 641 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 KCNH1O95259 989 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 NDST3O95803 873 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 DLGAP3O95886 979 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 PTTG1O95997 202 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 MT-CO1P00395 513 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 AVPP01185 164 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 SERPINE1P05121 402 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 BMP3P12645 472 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 GFAPP14136 432 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 EDN3P14138 238 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 ETS1P14921 441 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 GAP43P17677 238 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 MX2P20592 715 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 FGFR2P21802 821 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 RPL10P27635 214 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 PIK3R1P27986 724 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 ATICP31939 592 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 HSPA1LP34931 641 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 GRK3P35626 688 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 CBX5P45973 191 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 GABRB2P47870 512 aa3.69□□□□□ -1.82
FUBP1-211ENST00000489495 NUMBP49757 651 aa3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms