RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM40Q8WWA1 233 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA17Q96L03 361 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CROTQ9UKG9 612 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 KCNH4Q9UQ05 1017 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GIT1Q9Y2X7 761 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GLDCP23378 1020 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ADIGQ0VDE8 80 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PRKAA1Q13131 559 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SHCBP1Q8NEM2 672 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ASB9Q96DX5 294 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NEMP2A6NFY4 417 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MMP3P08254 477 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 FASP25445 335 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SULT1E1P49888 294 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PDK2Q15119 407 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 INAQ16352 499 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.32■□□□□ 0.26e-8■■■■■ 28.2
CCSAP-204ENST00000483092 MFSD3Q96ES6 412 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CEP44Q9C0F1 390 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TPK1Q9H3S4 243 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SPC25Q9HBM1 224 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SPAG4Q9NPE6 437 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SEPT3Q9UH03 358 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CPA4Q9UI42 421 aa16.32■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NR5A2O00482 541 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ACOT8O14734 319 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 IL1RL1Q01638 556 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB106AQ8N104 65 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB26Q9HCK0 441 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GNPTGQ9UJJ9 305 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 UBDO15205 165 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MYL3P08590 195 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ELK4P28324 431 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINB1P30740 379 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 OPRL1P41146 370 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GSSP48637 474 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 STX1BP61266 288 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CYP51A1Q16850 503 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO47Q5MNV8 452 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PHF21BQ96EK2 531 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MKS1Q9NXB0 559 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ERGIC3Q9Y282 383 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MEIS3P2A8K0S8 358 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 C9IYK1 514 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PFDN6O15212 129 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 AQP9O43315 295 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 INCA1Q0VD86 236 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GPR142Q7Z601 462 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC4FQ8N1N0 589 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ACDQ96AP0 544 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MOCS1Q9NZB8 636 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 BFARQ9NZS9 450 aa16.31■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 M0R3G1 203 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TREHO43280 583 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 BEST1O76090 585 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ALBP02768 609 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CTSHP09668 335 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 MATN1P21941 496 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SEPHS1P49903 392 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLC12A2P55011 1212 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DHRS12A0PJE2 317 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DLGAP3O95886 979 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 SLC7A1P30825 629 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 GRM5P41594 1212 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PLIN5Q00G26 463 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TMC5Q6UXY8 1006 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 FAM35AQ86V20 835 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 DDIASQ8IXT1 998 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 HTR3CQ8WXA8 447 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 CHST12Q9NRB3 414 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 ABCB10Q9NRK6 738 aa16.3■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CCSAP-204ENST00000483092 PCNAP12004 261 aa16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms