RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	ADAM17	P78536	824 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CRY1	Q16526	586 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	FATE1	Q969F0	183 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ULK1	O75385	1050 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CES1	P23141	567 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MSH4	O15457	936 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	OR1E1	P30953	314 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PEX6	Q13608	980 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	COL15A1	P39059	1388 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TPP1	O14773	563 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	IGSF6	O95976	241 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MT-CO1	P00395	513 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	NR2F1	P10589	423 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ACOX1	Q15067	660 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PFKFB4	Q16877	469 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	NWD1	Q149M9	1564 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SUV39H1	O43463	412 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	HMGCS2	P54868	508 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	HERC3	Q15034	1050 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	AMHR2	Q16671	573 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	UGT2B17	O75795	530 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	UPP2	O95045	317 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MGAT1	P26572	445 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	HERVK_113	P62684	666 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SVOPL	Q8N434	492 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	EXD2	Q9NVH0	621 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	E2F2	Q14209	437 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	SPESP1	Q6UW49	350 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26	4e-7	■□□□□ 8
NCOR2-208	ENST00000429285	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TIE1	P35590	1138 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	GJB7	Q6PEY0	223 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MGME1	Q9BQP7	344 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	ITGA10	O75578	1167 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MYBL2	P10244	700 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	TTPA	P49638	278 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	GPER1	Q99527	375 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NCOR2-208	ENST00000429285	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.4	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	CCNC	P24863	283 aa		13.4	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	PRKG2	Q13237	762 aa		13.4	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	MEA1	Q16626	185 aa		13.4	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.4	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		13.4	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	OR7A10	O76100	309 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	PIGN	O95427	931 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	TH	P07101	528 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	ANXA5	P08758	320 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	PSMD5	Q16401	504 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	RIT1	Q92963	219 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	XKR8	Q9H6D3	395 aa		13.39	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC30A4	O14863	429 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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