RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.75■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 HDAC10Q969S8 669 aa18.75■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 C7orf26Q96N11 449 aa18.75■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa18.75■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa18.75■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 GFRA2O00451 464 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 TGDSO95455 350 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CR2P20023 1033 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PTPN4P29074 926 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 ARRB2P32121 409 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 UGP2Q16851 508 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 SPATA6LQ8N4H0 392 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 OR6P1Q8NGX9 317 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 NDNQ99608 321 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CORO1BQ9BR76 489 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 FAM167BQ9BTA0 163 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PLK2Q9NYY3 685 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 ASB3Q9Y575 518 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CBX6O95503 412 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 FGF1P05230 155 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 ADH1AP07327 375 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 MYL4P12829 197 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 HLA-DPA1P20036 260 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CD151P48509 253 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CLNKQ7Z7G1 428 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 FAM13CQ8NE31 585 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 ELMO2Q96JJ3 720 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.597e-8■■■■□ 24.6
SIKE1-201ENST00000060969 VPS28Q9UK41 221 aa18.74■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 ANKRD36A6QL64 1941 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 INSIG1O15503 277 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 ZMPSTE24O75844 475 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 TMCC1O94876 653 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PDHA1P08559 390 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 MYL2P10916 166 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CPA3P15088 417 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CSKP41240 450 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CCR2P41597 374 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 GLRBP48167 497 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 ARFIP2P53365 341 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 WASHC2DQ5SRD0 308 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 OR13C4Q8NGS5 318 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 KCTD4Q8WVF5 259 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 TBATAQ96M53 351 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 FEM1AQ9BSK4 669 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 TLE6Q9H808 572 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 SCUBE2Q9NQ36 999 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 TLK1Q9UKI8 766 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CLEC4EQ9ULY5 219 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.73■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 G3V2L1 256 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 TK2O00142 265 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 NDST3O95803 873 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 LATS1O95835 1130 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CTNNB1P35222 781 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 TAS2R39P59534 338 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CDH18Q13634 790 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 ITGA9Q13797 1035 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC153Q494R4 210 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 ANKRD27Q96NW4 1050 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 TASP1Q9H6P5 420 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 NMRAL1Q9HBL8 299 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 HEY2Q9UBP5 337 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 RFPL2O75678 378 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 MT-CO1P00395 513 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PRLP01236 227 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 EPOP01588 193 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 SYN1P17600 705 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 HADHAP40939 763 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PRAMEP78395 509 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 PTPRRQ15256 657 aa18.72■□□□□ 0.59
SIKE1-201ENST00000060969 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms