RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pold2O35654 469 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Per3O70361 1113 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt10P02535 570 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SrgnP13609 152 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LynP25911 512 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asgr1P34927 284 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LdlrP35951 862 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mxd1P50538 227 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UtyP79457 1212 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Meaf6Q2VPQ9 191 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CblbQ3TTA7 982 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpd1lQ3ULJ0 351 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem198Q8BG75 360 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc184Q8BMK5 191 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stx16Q8BVI5 326 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Osbpl6Q8BXR9 959 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neu4Q8BZL1 478 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LipmQ8K2A6 422 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taf12Q8VE65 161 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef3Q91X46 524 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk33Q924X7 491 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fndc8Q9D2H8 321 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam227bQ9D518 532 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasgrp2Q9QUG9 608 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan5bB2RTN3 468 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr652B9EHE6 318 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bub1O08901 1058 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scg3P47867 471 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc39a14Q75N73 489 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1128Q7TR47 311 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fnip2Q80TD3 1108 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zmym6Q8BS54 1249 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp43Q8BUM9 1132 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cops7bQ8BV13 264 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb7Q8CDY9 829 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sorcs3Q8VI51 1219 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcaf2Q921K8 919 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Reep3Q99KK1 254 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim8Q99PJ2 551 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Poc5Q9DBS8 558 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akr1c12Q9JLI0 323 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr220E9Q050 325 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfaip1O70479 316 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AladP10518 330 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd3gP11942 182 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wnt6P22727 364 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pax3P24610 479 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wnt3aP27467 352 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elk4P41158 430 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ceacam5Q3UKK2 947 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MyrfQ3UR85 1138 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fut11Q8BHC9 489 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Galnt5Q8C102 930 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PigwQ8C398 503 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acad10Q8K370 1069 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igsf8Q8R366 611 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssx2ipQ8VC66 615 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rprd1aQ8VDS4 312 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb10Q91VE5 797 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lgals2Q9CQW5 130 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scube2Q9JJS0 997 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tagln3Q9R1Q8 199 aa12.75□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3173A6NAS3 172 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3020E9Q3J7 150 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm2897K7N6T7 172 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ChrngP04760 519 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mpp1P70290 466 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbp2P70695 339 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PgrQ00175 926 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2c65Q148B1 490 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptpn14Q62130 1189 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Brsk2Q69Z98 735 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r129Q7M709 320 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933402J07RikQ8BHX0 270 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3411Q8C7R2 150 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm12Q8R4X3 992 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adcy4Q91WF3 1077 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Catsper1Q91ZR5 686 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly6kQ9CWP4 154 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam227aQ9D3V8 625 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D454 513 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr45Q9EQQ4 373 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mpp6Q9JLB0 553 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps13aQ5H8C4 3166 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A1Y7VP24 259 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttll11A4Q9F4 727 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NuggcD3YWJ0 796 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TertO70372 1122 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctbp1O88712 441 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PdgfrbP05622 1098 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alas2P08680 587 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plk2P53351 682 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec1P97353 368 aa12.74□□□□□ -0.37
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20 ms