Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,25■■■■□ 3,71
Gm3173A6NAS3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Gm3173A6NAS3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Gm3173A6NAS3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,29■■■□□ 2,92
Gm3173A6NAS3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,21■■■□□ 2,91
Gm3173A6NAS3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,06■■■□□ 2,88
Gm3173A6NAS3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,54■■■□□ 2,8
Gm3173A6NAS3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Gm3173A6NAS3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Gm3173A6NAS3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Gm3173A6NAS3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,92■■■□□ 2,7
Gm3173A6NAS3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Gm3173A6NAS3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Gm3173A6NAS3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Gm3173A6NAS3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Gm3173A6NAS3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,14■■■□□ 2,57
Gm3173A6NAS3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Gm3173A6NAS3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,05■■■□□ 2,56
Gm3173A6NAS3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Gm3173A6NAS3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Gm3173A6NAS3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Gm3173A6NAS3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gm3173A6NAS3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Gm3173A6NAS3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Gm3173A6NAS3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Gm3173A6NAS3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,47■■■□□ 2,47
Gm3173A6NAS3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Gm3173A6NAS3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Gm3173A6NAS3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Gm3173A6NAS3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Gm3173A6NAS3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Gm3173A6NAS3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Gm3173A6NAS3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Gm3173A6NAS3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gm3173A6NAS3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Gm3173A6NAS3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Gm3173A6NAS3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Gm3173A6NAS3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Gm3173A6NAS3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Gm3173A6NAS3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Gm3173A6NAS3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Gm3173A6NAS3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Gm3173A6NAS3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Gm3173A6NAS3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Gm3173A6NAS3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Gm3173A6NAS3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,4■■■□□ 2,3
Gm3173A6NAS3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Gm3173A6NAS3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Gm3173A6NAS3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Gm3173A6NAS3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Gm3173A6NAS3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Gm3173A6NAS3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Gm3173A6NAS3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,14■■■□□ 2,26
Gm3173A6NAS3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gm3173A6NAS3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gm3173A6NAS3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Gm3173A6NAS3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Gm3173A6NAS3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Gm3173A6NAS3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Gm3173A6NAS3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Gm3173A6NAS3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Gm3173A6NAS3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Gm3173A6NAS3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Gm3173A6NAS3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Gm3173A6NAS3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Gm3173A6NAS3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Gm3173A6NAS3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Gm3173A6NAS3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gm3173A6NAS3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Gm3173A6NAS3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Gm3173A6NAS3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gm3173A6NAS3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Gm3173A6NAS3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Gm3173A6NAS3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Gm3173A6NAS3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Gm3173A6NAS3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Gm3173A6NAS3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Gm3173A6NAS3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Gm3173A6NAS3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Gm3173A6NAS3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Gm3173A6NAS3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,12
Gm3173A6NAS3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Gm3173A6NAS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Gm3173A6NAS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Gm3173A6NAS3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Gm3173A6NAS3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Gm3173A6NAS3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gm3173A6NAS3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gm3173A6NAS3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Gm3173A6NAS3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Gm3173A6NAS3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Gm3173A6NAS3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,11■■■□□ 2,09
Gm3173A6NAS3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Gm3173A6NAS3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Gm3173A6NAS3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gm3173A6NAS3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Gm3173A6NAS3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Gm3173A6NAS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Gm3173A6NAS3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Gm3173A6NAS3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms