RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	GCR1	P07261	785 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	CDC34	P14682	295 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	EXO5	P38289	585 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	NEO1	P40527	1151 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	YGL140C	P53120	1219 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	PEX13	P80667	386 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	GIS4	Q04233	774 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	DPH6	Q12429	685 aa		6.35	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	MSH3	P25336	1018 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	6.34	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	MTC5	Q03897	1148 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	MRL1	Q06815	381 aa		6.34	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	6.34	□□□□□ -1.39
RPC17	YJL011C	GUP1	P53154	560 aa		6.33	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	YTA7	P40340	1379 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	SHU2	P38957	223 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	TED1	P40533	473 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	NNF1	P47149	201 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	CWC24	P53769	259 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	GDE1	Q02979	1223 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	HDA2	Q06629	674 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	YIG1	Q08956	461 aa		6.32	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	6.31	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	RDH54	P38086	958 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	NEM1	P38757	446 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	PAN5	P38787	379 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	GIP2	P40036	548 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	EEB1	Q02891	456 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	RTT10	Q08924	1013 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	REC8	Q12188	680 aa		6.31	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	ALG14	P38242	237 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	HXT13	P39924	564 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	HXT17	P53631	564 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	HXT15	P54854	567 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	SLP1	Q12232	587 aa		6.29	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	TAF13	P11747	167 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	YKL077W	P36081	392 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	LEM3	P42838	414 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	YGR053C	P53234	283 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	SIW14	P53965	281 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RPC17	YJL011C	PRI2	P20457	528 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	SLS1	P42900	643 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	ROD1	Q02805	837 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	SPO71	Q03868	1245 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.26	□□□□□ -1.41	not detected
RPC17	YJL011C	YKL069W	P36088	180 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	ICP55	P40051	511 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	ERS1	P17261	260 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	IOC3	P43596	787 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	GCV1	P48015	400 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.25	□□□□□ -1.41	not detected
RPC17	YJL011C	OPI10	Q08202	246 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	ELG1	Q12050	791 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	YOL098C	Q12496	1037 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	NHA1	Q99271	985 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	RAD27	P26793	382 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	RER2	P35196	286 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	TAT2	P38967	592 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	ENT3	P47160	408 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	MEC3	Q02574	474 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	SAC7	P17121	654 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	EST2	Q06163	884 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	ESC2	Q06340	456 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	MKK2	P32491	506 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	AIM44	Q99299	758 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RPC17	YJL011C	BAS1	P22035	811 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	LYP1	P32487	611 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	AFG2	P32794	780 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	MDJ1	P35191	511 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	ADD66	P36040	267 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	SPO74	P45819	413 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	YJL049W	P47048	450 aa		6.21	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
RPC17	YJL011C	PHM7	Q12252	991 aa		6.21	□□□□□ -1.42

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.4 ms