RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 PDCL2Q8N4E4 241 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 TCP11L2Q8N4U5 519 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 UNC13BO14795 1591 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 HMOX1P09601 288 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF445P59923 1031 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 MAST1Q9Y2H9 1570 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 HS1BP3Q53T59 392 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 GPT2Q8TD30 523 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 MTHFSP49914 203 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 IDI1Q13907 227 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 KIF2CQ99661 725 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3C2GO75747 1445 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 CFAP53Q96M91 514 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 KIF3AQ9Y496 699 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 SNX21Q969T3 373 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 ERICH4A6NGS2 130 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 RUNDC1Q96C34 613 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 ATP10AO60312 1499 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 RICTORQ6R327 1708 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 CFAP74Q9C0B2 1584 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 NSD3Q9BZ95 1437 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 PTMSP20962 102 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 NOS1P29475 1434 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 FANCAO15360 1455 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 APBB1O00213 710 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 PRAM1Q96QH2 718 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 LAMC1P11047 1609 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 PLXNC1O60486 1568 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRT-211ENST00000618610 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 DCTN1Q14203 1278 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 USP25Q9UHP3 1055 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 MVPQ14764 893 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
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PTPRT-211ENST00000618610 ADGRL1O94910 1474 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 NGEFQ8N5V2 710 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 MCM5P33992 734 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 MADDQ8WXG6 1647 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 C14orf37Q86TY3 774 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 SMC4Q9NTJ3 1288 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 SYNMO15061 1565 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 NECTIN2Q92692 538 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 KIF16BQ96L93 1317 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 ERVK-7P63135 1459 aa10□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 CABP1Q9NZU7 370 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 NEO1Q92859 1461 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 MIS18AQ9NYP9 233 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 TRPM2O94759 1503 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 CLTCL1P53675 1640 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 PTPRTO14522 1441 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 ABCC1P33527 1531 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 SPC24Q8NBT2 197 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 UTRNP46939 3433 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 CD109Q6YHK3 1445 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 KRT24Q2M2I5 525 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-211ENST00000618610 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
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