RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 DDB1Q16531 1140 aa23.45■■□□□ 1.34
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PTPRS-208ENST00000590509 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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PTPRS-208ENST00000590509 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRS-208ENST00000590509 CABP1Q9NZU7 370 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRS-208ENST00000590509 AKAP12Q02952 1782 aa23.42■■□□□ 1.34
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PTPRS-208ENST00000590509 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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PTPRS-208ENST00000590509 SYT17Q9BSW7 474 aa23.37■■□□□ 1.33
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PTPRS-208ENST00000590509 CHD4Q14839 1912 aa23.29■■□□□ 1.32
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PTPRS-208ENST00000590509 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.27■■□□□ 1.32
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PTPRS-208ENST00000590509 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.26■■□□□ 1.31
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PTPRS-208ENST00000590509 ABCC6O95255 1503 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTPRS-208ENST00000590509 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.12■■□□□ 1.29
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PTPRS-208ENST00000590509 USP54Q70EL1 1684 aa23.11■■□□□ 1.29
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PTPRS-208ENST00000590509 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRS-208ENST00000590509 IFFO2Q5TF58 517 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRS-208ENST00000590509 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRS-208ENST00000590509 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRS-208ENST00000590509 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.96■■□□□ 1.27
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