RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 PIK3CDO00329 1044 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 RETREG2Q8NC44 543 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRM-208ENST00000578600 PDE4CQ08493 712 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF511Q8NB15 262 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF592Q92610 1267 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 FOXJ1Q92949 421 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 RNF223E7ERA6 249 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB33Q86T24 672 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 LINC01559Q495D7 138 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.31□□□□□ -0.92
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PTPRM-208ENST00000578600 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 SH3BP2P78314 561 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 ERFEQ4G0M1 354 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 ATG7O95352 703 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 SKIP12755 728 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.28□□□□□ -0.92
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PTPRM-208ENST00000578600 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PTPRM-208ENST00000578600 USP17L3A6NCW0 530 aa9.27□□□□□ -0.93
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PTPRM-208ENST00000578600 GGCXP38435 758 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 CDCA8Q53HL2 280 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM32Q13049 653 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 RNF135Q8IUD6 432 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRM-208ENST00000578600 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRM-208ENST00000578600 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 RPIAP49247 311 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 USTQ9Y2C2 406 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 ESPNB1AK53 854 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRM-208ENST00000578600 NCOA4Q13772 614 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 ARAP1Q96P48 1450 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 IFFO2Q5TF58 517 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-208ENST00000578600 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
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PTPRM-208ENST00000578600 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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PTPRM-208ENST00000578600 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 TOPBP1Q92547 1522 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 WIZO95785 1651 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 FAM196BA6NMK8 535 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 RNF20Q5VTR2 975 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 CARNS1A5YM72 827 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 PTK7Q13308 1070 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 EML3Q32P44 896 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.94
PTPRM-208ENST00000578600 USP17L15C9J2P7 530 aa9.17□□□□□ -0.94
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