RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 KCNQ2O43526 872 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-204ENST00000571386 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-204ENST00000571386 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-204ENST00000571386 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS2-204ENST00000571386 SLC24A1O60721 1099 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS2-204ENST00000571386 GCP02774 474 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS2-204ENST00000571386 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS2-204ENST00000571386 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SPNS2-204ENST00000571386 PIK3C2AO00443 1686 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS2-204ENST00000571386 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS2-204ENST00000571386 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 TMC1Q8TDI8 760 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 MYOM1P52179 1685 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 CRB1P82279 1406 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 SLIT3O75094 1523 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.34■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.33■■□□□ 1.33
SPNS2-204ENST00000571386 USP47Q96K76 1375 aa23.32■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 TESK2Q96S53 571 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 COL18A1P39060 1754 aa23.31■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 PLSCR1O15162 318 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.3■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 SOX12O15370 315 aa23.29■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 RGPD5Q99666 1765 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 DDB1Q16531 1140 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.28■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 CHD4Q14839 1912 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 TMF1P82094 1093 aa23.27■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SPNS2-204ENST00000571386 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 A0A1W2PP64 1363 aa23.26■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 ZBTB7AO95365 584 aa23.25■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.24■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 CDCA8Q53HL2 280 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 NME9Q86XW9 330 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 USP31Q70CQ4 1352 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 BCL9O00512 1426 aa23.23■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 USP54Q70EL1 1684 aa23.22■■□□□ 1.31
SPNS2-204ENST00000571386 NFAT5O94916 1531 aa23.22■■□□□ 1.31
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SPNS2-204ENST00000571386 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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SPNS2-204ENST00000571386 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.2■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 PROM2Q8N271 834 aa23.2■■□□□ 1.3
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SPNS2-204ENST00000571386 ABCC6O95255 1503 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.19■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 LTN1O94822 1766 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 STK32BQ9NY57 414 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 PAPPAQ13219 1627 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 TXNRD1Q16881 649 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS2-204ENST00000571386 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
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SPNS2-204ENST00000571386 SLC15A2Q16348 729 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS2-204ENST00000571386 COG3Q96JB2 828 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS2-204ENST00000571386 SYT17Q9BSW7 474 aa23.13■■□□□ 1.29
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SPNS2-204ENST00000571386 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC7Q96M83 1385 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS2-204ENST00000571386 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.08■■□□□ 1.29
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SPNS2-204ENST00000571386 EXOC5O00471 708 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
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SPNS2-204ENST00000571386 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 MAP3K5Q99683 1374 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 C1QTNF8P60827 252 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 ARXQ96QS3 562 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 CEP350Q5VT06 3117 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 IP6K1Q92551 441 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS2-204ENST00000571386 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
SPNS2-204ENST00000571386 FYB1O15117 783 aa23.01■■□□□ 1.27
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